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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】单原子的总能量怎么算？
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crystalgirl1

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】单原子的总能量怎么算？ 已有13人参与

我想计算FeSiH的结合能，（使用的是castep模块）
根据结合能公式Eb=E(FeSiH)-E(Fe)-E(Si)-E(H)，
我听说计算单原子的总能就是把一个单原子放在一个超晶胞里，超晶胞中只有这一个原子。我按照这种方法计算，可以算出Si的能量，但是一算到Fe就失败，请问我这种算法对吗？若对的话为什么Fe就算不了呢？
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1楼 2010-04-23 17:31:40
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

ym23

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
hometownlove(金币+2):谢谢交流 2010-04-28 18:48
你的方法是对的，还有一种发放可以解决不收敛的问题。
使用dmol模块，建立一个双原子或三原子的纯团簇，几何优化结构，得到如下结果。


用Total Energy 减去 Binding E，然后除以团簇的原子数，就是单原子的能量了。
这个可以保证收敛，双原子不收敛，三原子也会收敛的。
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博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
2楼2010-04-23 17:58:38
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shrek826

金虫 (小有名气)
★ ★
gavinliu7390(金币+2):谢谢交流！ 2010-04-23 22:48
你的方法是对的，算不出来是因为Fe不容易收敛，像Fe，Ni这些金属很难收敛
三个建议：
使用11x10x9的不对称盒子
k点使用Gamma点
增加nextra_bands和smearing
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7楼2010-04-23 22:17:39
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crystalgirl1

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yindeqiang at 2010-04-27 23:03:27:

今天计算了一下，与没计算完整的一个大盒子里放置一个Fe原子的方法，相差2-3eV，因此不能确定这个方法的正确性。在文献中，例如：Phy. Rev B 76中写的，计算IrN3形成能=E(IrN3)-E(solid Ir)-(3/2)E(solid molec ...

我刚问了一个师姐，她说这是算单质能量的方法，形成能对应的是单质的能量，结合能对应的是孤立原子的能量，两者不一样。
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16楼2010-04-28 15:20:05
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普通回帖

iamkz

至尊木虫 (小有名气)

寻识小生
★
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-04-23 22:47
结合能是不是就是减去孤立原子的能量？
那样的话你可以把原子放在超晶胞里，然后逐步改变晶格的大小，做一系列的计算，这样得到的曲线最后趋于稳定时的能量应该就是你所要的能量吧
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落花焉知流水之意
3楼2010-04-23 18:36:54
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
★
hometownlove(金币+1):谢谢交流 2010-04-28 18:48
是不是你的超元胞太大了，稍微小点就行
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
4楼2010-04-23 18:54:14
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crystalgirl1

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ym23 at 2010-04-23 17:58:38:
你的方法是对的，还有一种发放可以解决不收敛的问题。
使用dmol模块，建立一个双原子或三原子的纯团簇，几何优化结构，得到如下结果。

  ...

我没用过dmol3模块，不知道怎么建立你说的团簇，能说说具体操作步骤吗？
非常感谢！
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5楼2010-04-23 21:19:45
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crystalgirl1

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-04-23 18:54:14:
是不是你的超元胞太大了，稍微小点就行

我的超胞从1*1*1到5*5*5都试过了，都不行。
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6楼2010-04-23 21:21:02
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
失败有什么提示吗？结果文件里怎么显示的？
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
8楼2010-04-23 22:19:25
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yindeqiang

银虫 (正式写手)
能否算Fe晶胞的，然后除以晶胞所含的Fe原子的个数?
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9楼2010-04-23 23:53:40
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crystalgirl1

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by shrek826 at 2010-04-23 22:17:39:
你的方法是对的，算不出来是因为Fe不容易收敛，像Fe，Ni这些金属很难收敛
三个建议：
使用11x10x9的不对称盒子
k点使用Gamma点
增加nextra_bands和smearing

按你的方法试过了，可惜还是失败。不过还是很谢谢你！你曾经用这个方法算出来了？
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10楼2010-04-26 20:08:12
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