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xurong1127

新虫 (初入文坛)

[求助] PCR问题

各位大侠,谁能帮帮我啊!我构建MMP7质粒,克隆全长.上游引物:MMP7-F: 5’ CGGGATCCATC AAC CAT AGG TCC AAG AAC 3’
酶: BamHI
MMP7-R: 5’CGGAATTCTTT CTT TCT TGA ATT ACT TCT C 3’
酶: ECOR I
普通PCR根本做不出,模板换了好几种,用Touchdown可以做出淡淡的调带
我的反应条件是:95℃  3分钟  ,95℃ 45s  60-50℃逐渐降温 30s ,72℃ 1分钟,然后50℃
30个循环,  72℃ 10分钟  ,谁能帮我想想还有别的好办法吗? 我的引物也换过一次,之前的引物也是各种方法都试了!就是做出不去
我的反应体系  25微升  水 16.85  ,dNTP 4,  10xbf 2.5, 引物 1 0.2, 引物2 0.2  ,Taq酶 0.25 CDNA 1  ,

[ Last edited by xurong1127 on 2013-4-18 at 16:40 ]
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努力就有收获
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zhlf1989513

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2013-05-09 20:49:43
引用回帖:
11楼: Originally posted by xurong1127 at 2013-04-22 08:52:24
我的引物浓度时25um/L哦,我前天把引物量加到了0.5ul,变成了涂抹带,退火温度 ,我自己做了温度梯度的在59度左右,引物单子上是: F:Tm(50mMNa) 57.8  下游: Tm(50mMNa):51.1  想问下你以前出现过PCR 做不出来的现象吗? ...

你这对引物的Tm值怎么相差这么大呢?一般不要超过5度呢。。。总的来说如果引物特异性不好的话 降落应该挺管用的 万一不行你真的可以用重叠延伸试一下吧 我以前P较长片段的时候用过重叠延伸PCR。。。
keepon
12楼2013-04-22 09:40:41
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zhlf1989513

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
为什么要克隆全长呢?
keepon
2楼2013-04-18 18:07:21
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panyuzhu

禁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+3, MolEPI+1, 鼓励积极发帖帮助解答问题。 2013-04-18 20:12:07
问题都问不清楚
1.你的模板是什么啊?
       “模板换了好几种”这也叫线索啊?
2.你的目的是什么啊?
      “我构建MMP7质粒,克隆全长”,这也叫目的啊,MMP7是什么啊,克隆全长?那你直接转化质粒,提质粒,做个single digest不就是全长了。
3.实验情况是什么啊?
     “淡淡的条带”,你以为淡淡的忧伤啊。有条带你丫难道还P不出来了?(是条带,不是调)
4.你要P的目的条带全长基因多少啊?
     “95℃  3分钟  ,95℃ 45s  60-50℃逐渐降温 30s ,72℃ 1分钟,然后50℃
30个循环,  72℃ 10分钟  ”你确定45s,30s,1min分分钟能搞出下一代吗
5.反应30个循环,引物你加0.2ul?你看是不是太抠了点
欢迎交流
3楼2013-04-18 18:14:45
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xurong1127

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhlf1989513 at 2013-04-18 18:07:21
为什么要克隆全长呢?

我导师安排的,我也跟她说过,好多人构建这个基因质粒的,都不是全长呢!您有什么好办法吗?我都PCR一个月了,超级郁闷.
努力就有收获
4楼2013-04-19 08:58:29
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