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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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xjniudong

新虫 (小有名气)

[求助] 新手。。。求教。。如何定义改动的LJ势函数

这种类型改动过的LJ势函数在in文件中怎么定义啊???新手。。。不太懂,求各位大神帮助。。。

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[ Last edited by xjniudong on 2013-4-17 at 20:55 ]
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by xjniudong at 2013-04-18 08:56:10
具体是修改那个文件啊?...

呵呵,我没用过LAMMPS,不知道怎么加。Google了一下,这两个链接也许对你有用
http://lammps.sandia.gov/doc/Section_modify.html#mod_10
http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=18481&styleid=3

自己慢慢研究吧。搞分子模拟的,只要是用开源软件,最终都是要自己去修改代码来满足自己需要的。
4楼2013-04-18 11:02:53
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

这个公式可以简化成标准的LJ, 修正参数就可以了。。。。
7楼2013-04-21 18:38:36
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普通回帖

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

如果LAMMPS里没这个势能函数的话你只能改代码新定义一个势了。
2楼2013-04-18 01:23:53
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xjniudong

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2013-04-18 01:23:53
如果LAMMPS里没这个势能函数的话你只能改代码新定义一个势了。

具体是修改那个文件啊?
3楼2013-04-18 08:56:10
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xjniudong

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lsloneil at 2013-04-18 11:02:53
呵呵,我没用过LAMMPS,不知道怎么加。Google了一下,这两个链接也许对你有用
http://lammps.sandia.gov/doc/Section_modify.html#mod_10
http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=18481&styleid=3

自己 ...

thanks~~,任重而道远啊。。
5楼2013-04-18 17:22:31
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风雨无情8581

木虫 (正式写手)

你研究什么的,我也是纠结LJ势函数的问题,加我交流分子模拟,595422564
6楼2013-04-18 17:59:15
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风雨无情8581

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-04-21 18:38:36
这个公式可以简化成标准的LJ, 修正参数就可以了。。。。

能说确切一点嘛,我用forcite模拟,用的是UFF力场,但是范德华力处理的有问题,我的LJ参数没用上,不知道怎么用

力场参数.png

8楼2013-04-21 20:11:37
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你问题具体是什么? 把你的设置贴出来,结果出什么问题?
9楼2013-04-22 08:52:24
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风雨无情8581

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-04-22 08:52:24
你问题具体是什么? 把你的设置贴出来,结果出什么问题?

你好,我就是觉得我研究的物质LJ参数没用上,UFF力场中的vdw部分感觉用了不适合,我想能不能把我自己研究的物质的LJ参数改动到UFF力场中
10楼2013-04-22 09:27:10
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