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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » RNA干扰实验的分组
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scncwxy

木虫 (著名写手)

[求助] RNA干扰实验的分组

看网上说RNA干扰实验应该分为3组，分别是实验组，阴性对照组和Mock transfection组。mock trsnfection是不是只有转染试剂无siRNA？
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1楼 2013-04-15 14:13:30
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
同困惑，我也认为是只有转染试剂的空白组
但有人说是不规则小RNA组，跟RNAi序列碱基数一致，但序列随机组
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2楼2013-04-15 15:04:35
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
对照,举载体pLKO.1来说：
空载体对照： pLKO.1
scramble对照：pLKO.1-scramble shRNA（有人用针对GFP的siRNA，有人用针对Luc的siRNA，或者随机的19nt的siRNA）
转染试剂对照
什么都不处理的对照

这个对照真要深究起来，没完没了，一般target加scramble的就够了
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3楼2013-04-15 16:09:53
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scncwxy

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2013-04-15 16:09:53
对照,举载体pLKO.1来说：
空载体对照： pLKO.1
scramble对照：pLKO.1-scramble shRNA（有人用针对GFP的siRNA，有人用针对Luc的siRNA，或者随机的19nt的siRNA）
转染试剂对照
什么都不处理的对照

这个对照真要 ...

发文章一般要求做哪几组？
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4楼2013-04-15 16:26:18
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
scncwxy: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢帮助 2013-04-15 17:48:33
引用回帖:
4楼: Originally posted by scncwxy at 2013-04-15 16:26:18
发文章一般要求做哪几组？...

常规的两组就可以了
有人用vector + target
有人用scramble + target
选后者scramble + target比较好，其他不用，会增加很多工作量的
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2013-04-15 16:31:56
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FATVICKY

金虫 (正式写手)
阴性对照组就是随机干扰阻，MOCK就是转染试剂对照组。。。你说得那三组是必做的把
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6楼2013-04-15 21:16:02
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flashqd

铁虫 (正式写手)
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-04-29 14:10:01
很多杂志要求三种：实验组，空白组，以及对照组。对照组使用跟siRNA一样的序列，但顺序被打乱，并且搜索与基因组无同源性。这样做是为了说明干扰试验的特异性！
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7楼2013-04-15 21:27:55
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