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scncwxy

木虫 (著名写手)

[求助] RNA干扰实验的分组

看网上说RNA干扰实验应该分为3组,分别是实验组,阴性对照组和Mock transfection组。mock trsnfection是不是只有转染试剂无siRNA?
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
同困惑,我也认为是只有转染试剂的空白组
但有人说是不规则小RNA组,跟RNAi序列碱基数一致,但序列随机组
2楼2013-04-15 15:04:35
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gyesang

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优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
对照,举载体pLKO.1来说:
空载体对照: pLKO.1
scramble对照:pLKO.1-scramble shRNA(有人用针对GFP的siRNA,有人用针对Luc的siRNA,或者随机的19nt的siRNA)
转染试剂对照
什么都不处理的对照

这个对照真要深究起来,没完没了,一般target加scramble的就够了
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2013-04-15 16:09:53
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scncwxy

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2013-04-15 16:09:53
对照,举载体pLKO.1来说:
空载体对照: pLKO.1
scramble对照:pLKO.1-scramble shRNA(有人用针对GFP的siRNA,有人用针对Luc的siRNA,或者随机的19nt的siRNA)
转染试剂对照
什么都不处理的对照

这个对照真要 ...

发文章一般要求做哪几组?
4楼2013-04-15 16:26:18
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
scncwxy: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢帮助 2013-04-15 17:48:33
引用回帖:
4楼: Originally posted by scncwxy at 2013-04-15 16:26:18
发文章一般要求做哪几组?...

常规的两组就可以了
有人用vector + target
有人用scramble + target
选后者scramble + target比较好,其他不用,会增加很多工作量的
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2013-04-15 16:31:56
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FATVICKY

金虫 (正式写手)

阴性对照组就是随机干扰阻,MOCK就是转染试剂对照组。。。你说得那三组是必做的把
6楼2013-04-15 21:16:02
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flashqd

铁虫 (正式写手)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-04-29 14:10:01
很多杂志要求三种:实验组,空白组,以及对照组。对照组使用跟siRNA一样的序列,但顺序被打乱,并且搜索与基因组无同源性。这样做是为了说明干扰试验的特异性!
7楼2013-04-15 21:27:55
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