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李家小欣

银虫 (初入文坛)

[求助] 层错晶体结构的模型构建 已有1人参与

最近要做层错方面的模拟仿真,却是却不知道该用什么软件建立一个fcc的层错结构,只能够说是用ms剪切掉几个原子面但是抽取一层原子后的晶体结构该如何建立呢???
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jizw0704

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 历雨痕 at 2013-05-19 08:21:00
我想再问一下,在建立层错的过程中,需要对哪些结构进行优化吗?比如切出表面后建立晶胞结构需要优化吗?...

同学,你好,好长时间没有上小木虫了,今天才看到你的问题

一般情况下,我们在建立层错能时,使用的结构已经是优化后的,所以在建立好层错模型后,不需要再进行特殊的优化了。
但在计算层错的过程中,可以采用Selective dynamic,固定a,b方向,弛豫c方向

祝好
最爱——羽毛球
7楼2018-07-19 09:09:06
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jizw0704

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+3, 谢谢帮助 2013-04-11 21:50:33
同学,你好,我没有完全理解你的问题,
1、建立结构的话,我推荐使用MS软件吧,很方便的,如果你们实验室没有购买,可以再小木虫上找找有破解版的,哈哈,版本嘛都无所谓的
2、对与层错结构的建立,可以使用MS切面,然后将所切面做成3D结构,需要的话,再做成supercell,最后将你截得的两个或者多个这样的结构连接起来,连接的时候注意中间真空层的设置,可以设置一系列厚度,经行能量计算后,拟合得到最优的厚度值,进而展开进一步的计算。愿分享我自己的方法:
希望能给你的仿真模拟带来帮助,下面是具体的操作步骤:
1)MS切面,
用MS打开你要研究的结构,Build--Surfaces--Cleave Surface,在弹出的对话框中Cleave plane(h k l )一栏中,选择你所要切的晶面,最后选择Cleave就可以了;
2)将截面做成3D结构,
将所得截面打开,添加真空层,Build--Crystal--Build Vacuum Slab Crystal,真空层厚度Vacuum thickness一般按照结构周期修改,也可以选择0,最后Build就可以了;
3)建立supercell,
这一步比较简单,打开得到的3D结构,Build--Symmetry--Supercell,在弹出的对话框中,选择三个方向上的扩展就可以了;
4)同样的方法取得另一个截面的3Dsupercell;
5)连接两个supercell,
将两个supercell都打开,Build--Build Layers,在弹出的对话框中,将两个supercell添加到Layer 1,Layer2中,接着选择Layers Details --修改相应的Vacuum值,来得到一系列不同间隔的结构,最后Build就可以了;
6)对不同的结构计算能量,得到最后结构,继续下面的计算吧,
注意:结构的周期性问题,还有晶体结构的变形问题,望有用!
最爱——羽毛球
2楼2013-04-11 09:31:52
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历雨痕

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jizw0704 at 2013-04-11 09:31:52
同学,你好,我没有完全理解你的问题,
1、建立结构的话,我推荐使用MS软件吧,很方便的,如果你们实验室没有购买,可以再小木虫上找找有破解版的,哈哈,版本嘛都无所谓的
2、对与层错结构的建立,可以使用 ...

我想再问一下,在建立层错的过程中,需要对哪些结构进行优化吗?比如切出表面后建立晶胞结构需要优化吗?
3楼2013-05-19 08:21:00
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历雨痕

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jizw0704 at 2013-04-11 09:31:52
同学,你好,我没有完全理解你的问题,
1、建立结构的话,我推荐使用MS软件吧,很方便的,如果你们实验室没有购买,可以再小木虫上找找有破解版的,哈哈,版本嘛都无所谓的
2、对与层错结构的建立,可以使用 ...

另外就是我想问一下你这样建立只能建一种层错,比如是滑移一个伯矢,如果想滑移0。2或者0.5个伯矢呢?
4楼2013-06-04 08:23:51
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