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李家小欣

银虫 (初入文坛)

[求助] 层错晶体结构的模型构建 已有1人参与

最近要做层错方面的模拟仿真，却是却不知道该用什么软件建立一个fcc的层错结构，只能够说是用ms剪切掉几个原子面但是抽取一层原子后的晶体结构该如何建立呢？？？
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1楼 2013-04-10 20:12:40
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jizw0704

至尊木虫 (著名写手)

PhD

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+3, 谢谢帮助 2013-04-11 21:50:33
同学，你好，我没有完全理解你的问题，
1、建立结构的话，我推荐使用MS软件吧，很方便的，如果你们实验室没有购买，可以再小木虫上找找有破解版的，哈哈，版本嘛都无所谓的
2、对与层错结构的建立，可以使用MS切面，然后将所切面做成3D结构，需要的话，再做成supercell，最后将你截得的两个或者多个这样的结构连接起来，连接的时候注意中间真空层的设置，可以设置一系列厚度，经行能量计算后，拟合得到最优的厚度值，进而展开进一步的计算。愿分享我自己的方法：
希望能给你的仿真模拟带来帮助，下面是具体的操作步骤：
1）MS切面，
用MS打开你要研究的结构，Build--Surfaces--Cleave Surface,在弹出的对话框中Cleave plane（h k l ）一栏中，选择你所要切的晶面，最后选择Cleave就可以了；
2）将截面做成3D结构，
将所得截面打开，添加真空层，Build--Crystal--Build Vacuum Slab Crystal，真空层厚度Vacuum thickness一般按照结构周期修改，也可以选择0，最后Build就可以了；
3）建立supercell，
这一步比较简单，打开得到的3D结构，Build--Symmetry--Supercell，在弹出的对话框中，选择三个方向上的扩展就可以了；
4）同样的方法取得另一个截面的3Dsupercell；
5）连接两个supercell，
将两个supercell都打开，Build--Build Layers，在弹出的对话框中，将两个supercell添加到Layer 1，Layer2中，接着选择Layers Details --修改相应的Vacuum值，来得到一系列不同间隔的结构，最后Build就可以了；
6）对不同的结构计算能量，得到最后结构，继续下面的计算吧，
注意：结构的周期性问题，还有晶体结构的变形问题，望有用！
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最爱——羽毛球
2楼2013-04-11 09:31:52
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历雨痕

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jizw0704 at 2013-04-11 09:31:52
同学，你好，我没有完全理解你的问题，
1、建立结构的话，我推荐使用MS软件吧，很方便的，如果你们实验室没有购买，可以再小木虫上找找有破解版的，哈哈，版本嘛都无所谓的
2、对与层错结构的建立，可以使用 ...

我想再问一下，在建立层错的过程中，需要对哪些结构进行优化吗？比如切出表面后建立晶胞结构需要优化吗？
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3楼2013-05-19 08:21:00
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历雨痕

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jizw0704 at 2013-04-11 09:31:52
同学，你好，我没有完全理解你的问题，
1、建立结构的话，我推荐使用MS软件吧，很方便的，如果你们实验室没有购买，可以再小木虫上找找有破解版的，哈哈，版本嘛都无所谓的
2、对与层错结构的建立，可以使用 ...

另外就是我想问一下你这样建立只能建一种层错，比如是滑移一个伯矢，如果想滑移0。2或者0.5个伯矢呢？
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4楼2013-06-04 08:23:51
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zhuimeng527

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 历雨痕 at 2013-06-04 08:23:51
另外就是我想问一下你这样建立只能建一种层错，比如是滑移一个伯矢，如果想滑移0。2或者0.5个伯矢呢？...

我现在就面临和楼主一样的问题 如何用MS建好的模型滑移0.5个伯格斯矢量  不知道楼主解决了吗
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5楼2016-03-02 20:17:47
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喵喵喵想知道

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jizw0704 at 2013-04-11 09:31:52
同学，你好，我没有完全理解你的问题，
1、建立结构的话，我推荐使用MS软件吧，很方便的，如果你们实验室没有购买，可以再小木虫上找找有破解版的，哈哈，版本嘛都无所谓的
2、对与层错结构的建立，可以使用 ...

请问建立12层的是不是要先建6层的，然后把两个拼到一起
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6楼2018-07-17 16:54:04
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jizw0704

至尊木虫 (著名写手)

PhD

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 历雨痕 at 2013-05-19 08:21:00
我想再问一下，在建立层错的过程中，需要对哪些结构进行优化吗？比如切出表面后建立晶胞结构需要优化吗？...

同学，你好，好长时间没有上小木虫了，今天才看到你的问题

一般情况下，我们在建立层错能时，使用的结构已经是优化后的，所以在建立好层错模型后，不需要再进行特殊的优化了。
但在计算层错的过程中，可以采用Selective dynamic，固定a，b方向，弛豫c方向

祝好
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最爱——羽毛球
7楼2018-07-19 09:09:06
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