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ms粗粒化模型导入lammps
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shixiaocn
铁虫
(初入文坛)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 5
帖子: 7
在线: 24.3小时
虫号: 1406931
注册: 2011-09-18
专业: 电化学
[
求助
]
ms粗粒化模型导入lammps
请问ms里构建的粗粒化模型能不能导入lammps?论坛里看的用msi2lmp导入的方法,我试了下好像只能导入全原子模型。不知道大家的粗粒化模型都是怎么建立的?
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1楼
2013-04-07 22:58:37
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chaizhm
木虫
(著名写手)
模拟EPI: 2
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金币: 4805.4
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红花: 13
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在线: 267.9小时
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注册: 2011-04-02
性别: GG
专业: 半导体材料
【答案】应助回帖
粗粒化模型中每个球状的物体可能不是一个单独的原子,有可能是一个基团
以前本科做布朗动力学模拟dna,就是把dna离散成一段一段的,每一段用一个球代替
lammps是做分子模拟的,是原子的运动,我不知道有没有合适的力场来模拟基团之间的受力,你可以看看manul
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壁立万仞,无欲则刚
3楼
2013-04-11 17:19:17
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ddll_slsl
木虫
(正式写手)
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注册: 2012-11-12
专业: 动力学与控制
【答案】应助回帖
★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~
2013-04-11 17:15:39
粗粒化模型? coarse grain? 如果是, 那个同分子模拟是两个概念,势场也都不一样, 当然不能。
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2楼
2013-04-11 10:35:41
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