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shixiaocn

铁虫 (初入文坛)

[求助] ms粗粒化模型导入lammps

请问ms里构建的粗粒化模型能不能导入lammps?论坛里看的用msi2lmp导入的方法,我试了下好像只能导入全原子模型。不知道大家的粗粒化模型都是怎么建立的?
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-11 17:15:39
粗粒化模型? coarse grain?  如果是, 那个同分子模拟是两个概念,势场也都不一样, 当然不能。
2楼2013-04-11 10:35:41
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

粗粒化模型中每个球状的物体可能不是一个单独的原子,有可能是一个基团

以前本科做布朗动力学模拟dna,就是把dna离散成一段一段的,每一段用一个球代替

lammps是做分子模拟的,是原子的运动,我不知道有没有合适的力场来模拟基团之间的受力,你可以看看manul
壁立万仞,无欲则刚
3楼2013-04-11 17:19:17
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