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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » ms粗粒化模型导入lammps
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shixiaocn

铁虫 (初入文坛)

[求助] ms粗粒化模型导入lammps

请问ms里构建的粗粒化模型能不能导入lammps？论坛里看的用msi2lmp导入的方法，我试了下好像只能导入全原子模型。不知道大家的粗粒化模型都是怎么建立的？
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1楼 2013-04-07 22:58:37
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-11 17:15:39
粗粒化模型? coarse grain?  如果是， 那个同分子模拟是两个概念，势场也都不一样， 当然不能。
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2楼2013-04-11 10:35:41
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

粗粒化模型中每个球状的物体可能不是一个单独的原子，有可能是一个基团

以前本科做布朗动力学模拟dna，就是把dna离散成一段一段的，每一段用一个球代替

lammps是做分子模拟的，是原子的运动，我不知道有没有合适的力场来模拟基团之间的受力，你可以看看manul
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壁立万仞，无欲则刚
3楼2013-04-11 17:19:17
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