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lmcyjxs金虫 (正式写手)
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[交流]
引物酶切位点问题 已有6人参与
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| 大家好,我要做克隆表达,但是设计的引物没有加酶切位点,做TA克隆的话会不会比较麻烦?有没有比较好的方法改进啊?一般克隆载体大家用什么载体啊?还有表达载体大家又用什么呢? |
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dulei
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只要不加酶切位点时上下游引物的长度和GC含量差不多就可以。最好不要有错配,尤其是3‘端。发卡结构和二聚体影响不大(看看ΔG值,绝对值不要太大,一般10以下都能接受)。 加上酶切位点后,可以不考虑错配、发卡结构以及二聚体(根据经验,ΔG值的绝对值不会很高)。只要考虑引物长度和GC含量,以为这两个因素影响TM值。 在引物上设计酶切位点再往T载体上连那是因为T载体上没有想要的酶切位点,或者他们想测序看看PCR的片段是不是正确的。 完全可以不设计酶切位点,直接连到T载体上,用T载体上的酶切位点。 如果你后续还要连到其他载体(比如做表达),那我建议不要往T载体上连,你可以在引物上设计酶切位点并设计保护碱基,这样PCR后,可以直接酶切往相应载体上连。省时省力省钱。不用非得往T载体上连,做一次TA克隆比较贵,往T载体上连一般都是为了测序。 |
15楼2013-04-09 11:22:49
dulei
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2楼2013-04-01 15:13:14
dulei
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3楼2013-04-01 15:14:44
yuguiyan
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4楼2013-04-01 22:02:29










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