| 查看: 2119 | 回复: 0 | |||
jianana铁虫 (初入文坛)
|
[交流]
gromacs -atomtype not found
|
|
大家好，我现在要在oplsaa.ff力场中添加一个新的原子类型， 首先我在atomtypes.atp中添加 opls_966 55.847 ; FE in ferrocene 其次在ffbonded.itp中添加 [ bondtypes ] ; i j func b0 kb FE CA 1 0.20600 190.0 ; keep iron between cps [ angletypes ] ; i j k func th0 cth CA FE CA 1 40.4 627.6000 ; in ferrocene 第三：在ffnonbonded.itp中添加 opls_966 FE 26 55.847 +0.10 A 3.11 2.016 第四：在新的残基中加入FE相关参数， 但是我在运行 grompp -f em -c ferrocene_b4em -p ferrocene -o ferrocene_em时，出现如下错误： Atomtype opls_966 not found 这是什么原因呢？求大家帮助！ |
回复此楼» 猜你喜欢
求标准粉末衍射卡号 ICDD 01-076-1802
已经有0人回复
-
新西兰Robinson研究所招收全奖PhD
已经有0人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有222人回复
-
石墨烯转移--二氧化硅衬底石墨烯
已经有0人回复
-
笼目材料中量子自旋液体基态的证据
已经有0人回复
-
数学教学论硕士可以读数学物理博士吗？
已经有0人回复
-
德国亥姆霍兹Hereon中心汉堡分部招镁合金腐蚀裂变SCC课题方向2026公派博士生
已经有4人回复
-
澳门大学 应用物理及材料工程研究院 潘晖教授课题组诚招博士后
已经有11人回复
-
求助NH4V4O10晶体的CIF文件
已经有0人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
gromacs无法生成gro文件
已经有5人回复
- gromacs自己添加residue遇到的问题
已经有6人回复
- gromacs模拟分子在二氧化硅表面的吸附
已经有9人回复
- [新手求教]安装Gromacs后，查看pdb2gmx命令，显示无此命令
已经有9人回复
- 【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢
已经有11人回复
- 【求助】AMBER11安装问题
已经有5人回复
- 【求助】demo运行不了？
已经有12人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人