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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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jianana

铁虫 (初入文坛)

[交流] gromacs -atomtype not found

大家好,我现在要在oplsaa.ff力场中添加一个新的原子类型,  首先我在atomtypes.atp中添加             opls_966   55.847    ; FE in ferrocene   其次在ffbonded.itp中添加
                  [ bondtypes ]
               ; i    j  func       b0          kb

                FE    CA      1    0.20600      190.0   ; keep iron between cps
                 [ angletypes ]
            ;  i    j    k  func       th0       cth

         CA     FE     CA      1    40.4      627.6000  ; in ferrocene
  第三:在ffnonbonded.itp中添加
      opls_966   FE     26 55.847      +0.10        A    3.11         2.016


  第四:在新的残基中加入FE相关参数,
但是我在运行 grompp -f em -c ferrocene_b4em -p ferrocene -o ferrocene_em时,出现如下错误:
                      Atomtype opls_966 not found   这是什么原因呢?求大家帮助!
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