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jianana铁虫 (初入文坛)
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[交流]
gromacs -atomtype not found
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大家好,我现在要在oplsaa.ff力场中添加一个新的原子类型, 首先我在atomtypes.atp中添加 opls_966 55.847 ; FE in ferrocene 其次在ffbonded.itp中添加 [ bondtypes ] ; i j func b0 kb FE CA 1 0.20600 190.0 ; keep iron between cps [ angletypes ] ; i j k func th0 cth CA FE CA 1 40.4 627.6000 ; in ferrocene 第三:在ffnonbonded.itp中添加 opls_966 FE 26 55.847 +0.10 A 3.11 2.016 第四:在新的残基中加入FE相关参数, 但是我在运行 grompp -f em -c ferrocene_b4em -p ferrocene -o ferrocene_em时,出现如下错误: Atomtype opls_966 not found 这是什么原因呢?求大家帮助! |
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