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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » Gaussian结构优化问题！！！
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柳誉

铁虫 (小有名气)

[求助] Gaussian结构优化问题！！！

我是Gaussian的初学者，经验欠缺，恳请各位前辈赐教！

我对一个分子量为250多的分子进行结构优化和频率计算，可是最后得到的优化结构与一些外国网站和Chem3D中minimize energy操作后的结构有大的区别：高斯得出的结构各原子几乎都在一个平面上，而后者能明显看出环之间有一个近50度的夹角。

计算设置参数如下
Method:   Ground State        DFT...       Restricted        B3LYP
Basis Set:    6-31G      d
Charge:    0      spin:   Singlet

（# opt freq=noraman rb3lyp/6-31g(d) geom=connectivity）
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1楼 2013-03-22 10:18:51
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dai_shen844

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我感觉把5楼的两个初始构型导入到高斯里面计算，计算结果应该相差无几~
小卒一名，过来探讨一下~
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潜心
6楼2013-05-23 17:53:43
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yanrding

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
理论上，按照你的Gaussian计算设置，应该比chem3d的计算等级高，应该更可信些。
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华北电力大学（北京）数理学院，计算化学，凝聚态物理。欢迎合作！招硕士/博士研究生，招老师。
2楼2013-03-22 10:57:12
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柳誉

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yanrding at 2013-03-22 10:57:12
理论上，按照你的Gaussian计算设置，应该比chem3d的计算等级高，应该更可信些。

可是有些外国网站的给出的3D模型是和Chem3D的更接近，比如
http://www.chemicalize.org/
http://www.chemspider.com/
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
等网站所提供的3D模型。我不知道这些网站提供的信息可信度如何，但他们所提供的模型看，还是有一定的一致性，这样应该不会只是偶然吧？
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3楼2013-03-22 13:13:51
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stalart

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个和你做的初始模型有直接关系，不能指望Gaussian跨越加大
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4楼2013-03-22 19:09:04
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