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柳誉

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[求助] Gaussian结构优化问题！！！

我是Gaussian的初学者，经验欠缺，恳请各位前辈赐教！

我对一个分子量为250多的分子进行结构优化和频率计算，可是最后得到的优化结构与一些外国网站和Chem3D中minimize energy操作后的结构有大的区别：高斯得出的结构各原子几乎都在一个平面上，而后者能明显看出环之间有一个近50度的夹角。

计算设置参数如下
Method: Ground State       DFT...    Restricted       B3LYP
Basis Set: 6-31G    d
Charge: 0    spin: Singlet

（# opt freq=noraman rb3lyp/6-31g(d) geom=connectivity）

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1楼 2013-03-22 10:18:51

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柳誉

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引用回帖:

2楼: Originally posted by yanrding at 2013-03-22 10:57:12
理论上，按照你的Gaussian计算设置，应该比chem3d的计算等级高，应该更可信些。

可是有些外国网站的给出的3D模型是和Chem3D的更接近，比如
http://www.chemicalize.org/
http://www.chemspider.com/
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
等网站所提供的3D模型。我不知道这些网站提供的信息可信度如何，但他们所提供的模型看，还是有一定的一致性，这样应该不会只是偶然吧？