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Gaussian结构优化问题！！！
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我是Gaussian的初学者，经验欠缺，恳请各位前辈赐教！ 我对一个分子量为250多的分子进行结构优化和频率计算，可是最后得到的优化结构与一些外国网站和Chem3D中minimize energy操作后的结构有大的区别：高斯得出的结构各原子几乎都在一个平面上，而后者能明显看出环之间有一个近50度的夹角。 计算设置参数如下 Method: Ground State DFT... Restricted B3LYP Basis Set: 6-31G d Charge: 0 spin: Singlet （# opt freq=noraman rb3lyp/6-31g(d) geom=connectivity） |
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5楼2013-03-22 20:02:12
2楼2013-03-22 10:57:12
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可是有些外国网站的给出的3D模型是和Chem3D的更接近，比如 http://www.chemicalize.org/ http://www.chemspider.com/ http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ 等网站所提供的3D模型。我不知道这些网站提供的信息可信度如何，但他们所提供的模型看，还是有一定的一致性，这样应该不会只是偶然吧？ |
3楼2013-03-22 13:13:51
stalart
木虫 (正式写手)
- 应助: 284 (大学生)
- 金币: 1541.4
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- 帖子: 488
- 在线: 129小时
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- 注册: 2012-09-09
- 专业: 理论和计算化学
4楼2013-03-22 19:09:04