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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化图形可视化软件 » 求坐标和键长的关系
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skysky112211

木虫 (小有名气)

NaNa

[求助] 求坐标和键长的关系

最近在写si，发现需要键长数据，试问有没有什么直接的推导方法，使用excel可以直接根据原子的坐标直接得到键长，谢谢
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NaNa
1楼 2013-03-17 20:24:42
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fmying

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2013-03-18 13:58:17
键长就是两个原子之间的距离啊。只要有两个原子的坐标就行，和什么软件无关，关键是知道函数就好。
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上善若水
2楼2013-03-18 11:20:18
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skysky112211

木虫 (小有名气)

NaNa
引用回帖:
2楼: Originally posted by fmying at 2013-03-18 11:20:18
键长就是两个原子之间的距离啊。只要有两个原子的坐标就行，和什么软件无关，关键是知道函数就好。

我用两点间距离算了一下，于键长不同
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NaNa
3楼2013-03-18 18:43:38
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fmying

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

单位是什么？坐标的单位和键长的单位一致么？
计算软件中的键长就是这么计算得来的，没有其它特别的方法。
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上善若水
4楼2013-03-18 21:41:43
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skysky112211

木虫 (小有名气)

NaNa
以苯环为例 优化后坐标

6        1.259364000     -0.631896000      0.000928000
6        2.644198000     -0.631968000      0.001411000
6        3.336605000      0.567178000      0.000830000
6        2.644243000      1.766517000     -0.000158000
6        1.259545000      1.766590000     -0.000610000
6        0.567071000      0.567325000     -0.000094000
1        0.723396000     -1.560226000      0.001345000
1        3.180073000     -1.560355000      0.002097000
1        4.408548000      0.567191000      0.001121000
1        3.180319000      2.694786000     -0.000634000
1        0.723565000      2.694916000     -0.001351000
1       -0.504872000      0.567439000     -0.000452000

为苯环使用 hf 3-21g opt结果
以上为使用chemdraft 显示的以埃为单位的坐标
碳碳键长为 1.38470，使用两点距离公式计算 为 1.242329
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NaNa
5楼2013-03-18 21:48:04
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skysky112211

木虫 (小有名气)

NaNa
是以4号C和5号C 给的键长
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NaNa
6楼2013-03-18 21:48:45
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fmying

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
skysky112211: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 是我算错了 谢谢 2013-03-19 07:21:17
我在Linux下用一个简单的计算工具 bc 计算得到的：

sqrt((2.644243000-1.259545000)^2+(1.766517000-1.766590000)^2+(0.000610000-0.000158000)^2)
1.38469807569628694129

第一行是输入，第二行是输出的结果。就是1.38470。
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上善若水
7楼2013-03-18 22:26:59
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