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没入尘埃5

金虫 (小有名气)

[求助] EST序列是什么啊?具体作用是什么啊?

多谢各位帮忙了!
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没入尘埃5

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ysy000000 at 2013-03-08 10:58:26
简单点说是 mRNA的一部分  人们在对cDNA PCR扩增的过程中 获得的产物 既然是mRNA的一部分作用当然跟mRNA一样

这个。。。EST的作用跟mRNA一样?
如果不努力,肯定没收获!
5楼2013-03-11 16:29:47
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ysy000000

木虫 (正式写手)

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★ ★
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没入尘埃5: 金币+2, 有帮助 2013-03-11 16:37:02
简单点说是 mRNA的一部分  人们在对cDNA PCR扩增的过程中 获得的产物 既然是mRNA的一部分作用当然跟mRNA一样
劳其筋骨,饿其体肤。
2楼2013-03-08 10:58:26
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
没入尘埃5: 金币+1, 有帮助 2013-03-11 16:37:23
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2013-03-08 15:32:23
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axian

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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没入尘埃5: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-03-11 16:37:34
gyesang: 金币+2, 鼓励应助 2013-03-13 20:21:12
EST就是某个基因所转录的mRNA的一部分,可以用它来代替这个mRNA 从而使用生物信息学分析如blast来注释这个基因的功能等信息。
举个例子:假如一个2kbp的x基因转录成的mRNA长1.5k,我们在测序的时候先要建立cDNA文库,将cDNA随机打断成小片段,测序后得到小片段的长度为400bp(这个与测序仪相关),这里的这段400bp的小片段就做contig,利用生物信息学软件对contig进行拼接,我们得到了1k左右的片段信息,那么此段序列就可以成为EST序列,我们可以用它来代表x基因来注释功能,或者利用它通过RACE等技术得到全长的1.5KmRNA.
纯属个人理解,如有欠妥之处 欢迎大侠指正~
4楼2013-03-08 20:07:45
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