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没入尘埃5金虫 (小有名气)
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[求助]
EST序列是什么啊？具体作用是什么啊？
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axian
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【答案】应助回帖
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gyesang: 金币+2, 鼓励应助 2013-03-13 20:21:12
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gyesang: 金币+2, 鼓励应助 2013-03-13 20:21:12
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EST就是某个基因所转录的mRNA的一部分，可以用它来代替这个mRNA 从而使用生物信息学分析如blast来注释这个基因的功能等信息。 举个例子：假如一个2kbp的x基因转录成的mRNA长1.5k，我们在测序的时候先要建立cDNA文库，将cDNA随机打断成小片段,测序后得到小片段的长度为400bp（这个与测序仪相关），这里的这段400bp的小片段就做contig，利用生物信息学软件对contig进行拼接，我们得到了1k左右的片段信息，那么此段序列就可以成为EST序列，我们可以用它来代表x基因来注释功能，或者利用它通过RACE等技术得到全长的1.5KmRNA. 纯属个人理解，如有欠妥之处 欢迎大侠指正~ |
4楼2013-03-08 20:07:45
ysy000000
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2楼2013-03-08 10:58:26
gyesang
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【答案】应助回帖
★
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没入尘埃5: 金币+1, ★有帮助 2013-03-11 16:37:23
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3楼2013-03-08 15:32:23
没入尘埃5
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5楼2013-03-11 16:29:47
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