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gromacs4.5.5安装出错 configure: error: cannot compute sizeof (off_t)
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configure: error: cannot compute sizeof (off_t) See `config.log' for more details. |
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spirte雷
木虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 2671.7
- 散金: 100
- 帖子: 89
- 在线: 146.7小时
- 虫号: 2197629
- 注册: 2012-12-20
- 性别: GG
- 专业: 环境工程
2楼2013-03-07 12:57:37
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gromacs安装流程 (1) 解压缩fftw，lam-mpi，gromacs源码 tar -zxvf fftw-3.1.2.tar.gz tar –zxvf gromacs-3.3.1.tar.gz tar -zxvf lam-7.1.3.tar.gz (2) 编译lam-mpi cd lam-7.1.3 ./configure --prefix=/home/lam-7.1.3 --without-fc --with-rsh="ssh-x" make make install 注：--without-fc是不编译mpif77，可以去掉 (3) 添加mpi环境变量 export PATH=$PATH:/home/lam-7.1.3/bin ( append to .bashrc) (4) 编译fftw单双精度版 cd fftw-3.1.2 ./configure --enable-float --enable-mpi --prefix=/home/fftw-3.1.2 make make install make distclean ./configure --disable-float --enable-mpi --prefix=/home/fftw-3.1.2 (3) 设置fftw环境变量 export CPPFLAGS=-I/home/fftw-3.1.2/include export LDFLAGS=-L/home/fftw-3.1.2/lib (4) 编译gromacs cd gromacs-3.3.1 ./configure --prefix=/home/gromacs-3.3.1 --enable-mpi make make install make distclean ./configure --prefix=/home/gromacs-3.3.1 --program-suffix=_d --enable-mpi --disable-float (5) 设置gromacs环境变量 export PATH=$PATH:/home/gromacs-3.3.1/bin ( append to .bashrc) |
3楼2013-03-07 16:47:49
4楼2013-03-07 16:48:20