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月下飞雪

金虫 (小有名气)


[交流] 针对靶点的小分子设计,大家有什么实用的方法?

如题,大家说说经验吧,大部头的专著推荐就算了,实用为主
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wwwtony

铁杆木虫 (正式写手)



月下飞雪(金币+1): 谢谢参与
我也是刚刚开始做这个方向,懂的也不多,谈下自己的体会吧。首先是看文献,J Med Chem,Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters,MedChemCom,看针对你要做的疾病有什么靶点,比如抗肿瘤,有很多靶点,topoisomerase, Bcl-2, BCR-ABL, p53-MDM2, 了解一下,目前的研究状况,然后上CNKi看看综述,看中文容易理解一些,知道针对靶点都有些什么先导化合物在研,到了什么阶段,这些化合物结构有什么特点,结构骨架是怎么改造的,IC50做到多少了,然后根据你手头的化合物类型,找个合适的靶点虚拟对接一下,看看打分情况,有时打分情况不太乐观,没关系,可能是软件程序的问题,或者是靶点没选好,换个对接软件或者靶点再试试,这样做下去慢慢就有思路了。
24楼2013-02-28 09:09:24
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userhung

禁虫 (文学泰斗)


14楼2013-02-25 16:28:20
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