24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

jasminezhao

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1893.6
散金: 66
帖子: 135
在线: 876小时
虫号: 2170838
注册: 2012-12-06
性别: MM
专业: 免疫生物学

[交流] 蛋白质大小的计算已有4人参与

先请教一下各位高手蛋白质的大小怎么求？已知该蛋白质的长为1389aa，相对分子质量为114718.07m.w.,怎么转化成多少KD啊？有的人说，用1389/3*110，还有的人说114718.07/1000及转换成KD。可是为什么两个计算方法的结果不一样呢？希望各位大侠指点迷津！！

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

急寻求测定蛋白质二硫键（应用到NTSB试剂的实验方法）后的计算方法已经有5人回复
问一下常见的蛋白质的直径大小范围已经有6人回复
根据某种蛋白质的氨基酸分析结果计算htot（水解度要用的常数值）已经有11人回复
耗散粒子动力学中珠子体积大小的不同已经有5人回复
如何查找已知蛋白质、酶的结构、空间尺寸大小？已经有4人回复
求助蛋白质分子三维尺寸已经有12人回复
求助晶粒大小计算的问题已经有3人回复
怎么计算分子的大小？已经有8人回复
怎样根据XRD计算晶体颗粒大小已经有6人回复
【求助/交流】如何测定蛋白质的分子量大小？已经有11人回复
【求助/交流】序列长短与蛋白质大小的关系已经有3人回复
【求助/交流】蛋白质大小已经有13人回复

1楼 2013-02-18 19:40:34

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zyx335588

捐助贵宾 (正式写手)

应助: 8 (幼儿园)
金币: 6713.2
散金: 50
红花: 5
帖子: 459
在线: 417.5小时
虫号: 990100
注册: 2010-04-06
性别: GG
专业: 植物病理学

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

第一种计算方法应该是一种采用平均值的近似计算，但是计算时似乎错了一点儿问题，根据楼主帖中的介绍“已知该蛋白质的长为1389aa，相对分子质量为114718.07m.w.",考虑到20种氨基酸得平均分子量及某些氨基酸在蛋白中的出现概率，在计算蛋白的相对分子量是可近似认为1个氨基酸是110Da，那么1389个氨基酸应该近似为1389*110=152790，即近似为152kD。楼主给出的计算公式好像是认为该蛋白质的编码序列为1389bp，那么除以3得到氨基酸数。但是既然是平均，那么具体的蛋白质中各氨基酸的含量就会与平均值出现差别，因此该值仅作不知道序列时的参考。
楼主给出的第二个数值，应该是使用一些软件计算出的分子量吧。已知道蛋白质的氨基酸序列的情况下，那么该蛋白质的分子式是可以写出的，从而计算出准确的分子量。如果楼主给的第二个数值来源于此，那么该值是可信的。
另外楼主的Western Blot在115kD和51kD均出现条带，不知道楼主使用的什么材料来做的。楼主可以考虑一下几方面，如果是原核表达/体外纯化，是不是该蛋白质在表达过程中由于稀有密码子问题出现截短表达，或纯化过程中存在降解，115kD已经不小了，存在境界的可能性还是很大的。如果是体内材料来做的话，考虑是不是该材料在体内本身就存在两种不同的形式，来行使不同的功能。
希望对楼主有所帮助。

赞一下(3人)