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opaler

铁杆木虫 (著名写手)


[交流] 请教一个问题,谢谢回复!

本人没有做过分子模拟,有个问题想请教一下:
我想知道,在水溶液中,某些小分子在蛋白质,如溶菌酶等的表面,通过非共价键结合的情况,不知能否模拟实现!现在还不知到小分子如何选择。
any hint will be appreciable!
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spirte雷

木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
至于什么小分子这要在文献中找,但是模拟小分子和蛋白的结合情况是完全可以的,但是有些小分子力场没有它的数据,这需要用到PRODRG跑一下那个小分析,完后加到模拟中
7楼2013-03-21 07:50:44
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opaler

铁杆木虫 (著名写手)


或者我想知道,能否模拟蛋白质和核酸适配体的结合过程
2楼2013-02-08 21:32:29
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043114076

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★
opaler: 金币+5, 谢谢!有什么不懂的再请教! 2013-02-10 19:39:40
opaler: 金币+1, 谢谢回复! 2013-03-07 21:27:26
当然可以

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2013-02-09 18:31:58
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chenjung0825

木虫 (小有名气)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2013-03-03 09:06:32
opaler: 金币+1, 谢谢回复!不懂再请教! 2013-03-07 21:27:51
可以,但是前提是待研究蛋白的结构已知!
5楼2013-02-20 12:14:10
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