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xy656691

金虫 (正式写手)

[求助] 帮忙看下NCBI中这个网页吧,对里面有些内容不太懂

这个链接http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... 358&to=24915210,我想查找ARF2这个基因的cds序列,为什么打开之后,这个网页里面出现了三个cds,分别是什么意思呢?

[ Last edited by xy656691 on 2013-1-27 at 13:39 ]
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的这个序列是基因组序列 Arabidopsis thaliana chromosome 5, complete sequence
意思就是拟南芥 5号染色体 全序列,如果再看右边,序列只显示了from:  24910358 to:  24915210
这个序列对你要看你那个ARF2基因序列基本没有用,你要查ARF2的cds,你应该查这个基因的参考序列,就是NM_开头的序列号,在刚才那个页面中,左侧下拉菜单,选 gene ,然后右边输入ARF2即可,搜索出来第一条就是,点击进入新的页面,下面就可以找到你该基因的参考序列了
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2013-01-28 10:48:01
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snoopyzxx

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你不管能搜出多少相同或相似序列,你把所有这个基因的序列都下载下来,用软件比对一下,就可以知道其中具体有什么差别了。
三个序列,说明有三个不同的人提交了这个基因的序列,但至于三个序列有没有差别,你要自己比对,大部分情况可能是核酸序列有少量差异,但蛋白质序列没有差异,也可能蛋白质也有差异,你就要认真研究下,具体哪个是正确的。因为NCBI是个一级数据库,里面的序列都是没有经过专业核对的,个人都可以提交,所以质量不是绝对很高。
要确认的话,你可以在某些二级数据库继续搜索。比如nature的antibodypedia。
VX:19192310212;公众号:生物技术与IVD
2楼2013-01-27 12:20:15
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