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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 帮忙看下NCBI中这个网页吧，对里面有些内容不太懂
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xy656691

金虫 (正式写手)

[求助] 帮忙看下NCBI中这个网页吧，对里面有些内容不太懂

这个链接http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... 358&to=24915210，我想查找ARF2这个基因的cds序列，为什么打开之后，这个网页里面出现了三个cds,分别是什么意思呢？

[ Last edited by xy656691 on 2013-1-27 at 13:39 ]
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1楼 2013-01-27 11:43:40
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snoopyzxx

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你不管能搜出多少相同或相似序列，你把所有这个基因的序列都下载下来，用软件比对一下，就可以知道其中具体有什么差别了。
三个序列，说明有三个不同的人提交了这个基因的序列，但至于三个序列有没有差别，你要自己比对，大部分情况可能是核酸序列有少量差异，但蛋白质序列没有差异，也可能蛋白质也有差异，你就要认真研究下，具体哪个是正确的。因为NCBI是个一级数据库，里面的序列都是没有经过专业核对的，个人都可以提交，所以质量不是绝对很高。
要确认的话，你可以在某些二级数据库继续搜索。比如nature的antibodypedia。
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VX：19192310212；公众号：生物技术与IVD
2楼2013-01-27 12:20:15
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你的这个序列是基因组序列 Arabidopsis thaliana chromosome 5, complete sequence
意思就是拟南芥 5号染色体 全序列，如果再看右边，序列只显示了from:  24910358 to:  24915210
这个序列对你要看你那个ARF2基因序列基本没有用，你要查ARF2的cds，你应该查这个基因的参考序列，就是NM_开头的序列号，在刚才那个页面中，左侧下拉菜单，选 gene ，然后右边输入ARF2即可，搜索出来第一条就是，点击进入新的页面，下面就可以找到你该基因的参考序列了
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2013-01-28 10:48:01
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