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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助生物专业虫友：详细查询蛋白二级结构的方法
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hsd3521

主管区长 (知名作家)

火星驻地球联络处主任科员

优秀区长优秀版主优秀版主

[求助] 求助生物专业虫友：详细查询蛋白二级结构的方法

我做了红外，并对改蛋白的二级结构进行了分析，现在想在数据库中进行比对，但是在PDB等数据库中看到的是该种蛋白的三级结构，所以特向虫友请教如何查找特定蛋白的二级结构（螺旋、折叠等信息），因为非生物学专业，烦请详细指教，谢谢
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蛋白质二级结构

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太胖了！~
1楼 2013-01-25 08:20:34
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zhang881007

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hsd3521: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢 2013-01-25 12:24:55
zhou-Fassman 方法是用于判断二级结构的方法，zhou，是中国人，邹承鲁先生
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shine
3楼2013-01-25 08:58:44
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
hsd3521: 金币+1, ★有帮助, 谢谢 2013-01-25 12:24:45
https://au.expasy.org/tools/里面有蛋白质二级结构预测的
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2楼2013-01-25 08:37:58
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hsd3521

主管区长 (知名作家)

火星驻地球联络处主任科员

优秀区长优秀版主优秀版主
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhang881007 at 2013-01-25 08:58:44
zhou-Fassman 方法是用于判断二级结构的方法，zhou，是中国人，邹承鲁先生

非常感谢您的帮助，我已经按照这个方法做了二级结构预测，但是如何得到比如螺旋、折叠等二级结构所占的比例那？请指教，谢谢
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太胖了！~
4楼2013-01-25 12:24:26
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hsd3521

主管区长 (知名作家)

火星驻地球联络处主任科员

优秀区长优秀版主优秀版主
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhang881007 at 2013-01-25 08:58:44
zhou-Fassman 方法是用于判断二级结构的方法，zhou，是中国人，邹承鲁先生

比如说这个结果
Total Residues: H: 579   E: 484   T: 127  
       Percent: H: 58.6  E: 49.0  T: 12.9
为什么没有无规卷曲的比例
另外这个百分率是大于100的
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太胖了！~
5楼2013-01-25 13:00:46
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