24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 12914  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mjzjily

铜虫 (初入文坛)

[求助] DpnI 酶消化不了模板,求解。

我最近用PCR扩增的方法扩增线性化质粒,扩增之后用DpnI消化模板。但是构建后依然有很多的假阳性,说明DpnI酶没有起作用。我的质粒是用DH5α扩增的。之前也试过将质粒线性化后再PCR,但多次试验发现不可行。主要问题就是为什么DpnI酶没有起作用?另外,我现在也计划先将质粒甲基化酶处理再做PCR后,在用DpnI酶消化,不知道哪些甲基化酶比较好?谢谢各位!
回复此楼
扎实科研
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

greenygreen

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
mjzjily: 金币+2 2013-01-25 14:17:18
你所说的消化模版,是指要消化PCR反应中加入的质粒DNA模版么?那应该完全没有问题。因为DH5a菌株提出的质粒本身就是带有甲基化位点的,完全可以被消化。这也是基于PCR-DpnI消化法制备突变质粒的原理。而且假阳性不代表完全没有被消化,这与模版的量以及酶的活性有关。应多挑些验证或者确认酶的活性。
3楼2013-01-23 20:12:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

yesali

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+4, 鼓励发帖交流问题。 2013-01-23 18:55:48
mjzjily: 金币+1 2013-01-25 14:17:07
DpnI酶的碱基识别序列要甲基化才能被切开,PCR产物没有被甲基化吧?

不知道你的DpnI位点在产物的什么部分,如果你设计引物时加入的酶切位点,那么就有一个末端酶切效率(酶切位点在末端是,很多酶的酶切效率会很低)的问题,建议在引物设计时除了加入酶切位点外,末端再加入两个左右的碱基,以提高酶切效率。
2楼2013-01-23 16:18:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Haibara_Ai

铜虫 (小有名气)

你有做对照吗,没加dpnI的假阳性率和加了的,不然你怎么能确定没发挥作用
4楼2013-01-23 21:54:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

0405lanfeng

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
mjzjily: 金币+3 2013-01-25 14:17:52
我前几天做定点突变 用的NEB的 Dpn1,效果还不错。你说的先消化后扩增,我觉得不行,这样很可能把你要的片段都给切断的。还有,消化的时间可以延长,protocol 说一两个小时就够了 不过我至少五个小时 还有次是过夜的。各人认为消化久了好~

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2013-01-24 07:54:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 药学305求调剂 +6 玛卡巴卡boom 2026-04-11 6/300 2026-04-14 19:48 by zhouxiaoyu
[考研] 327求调剂 +23 Xxjc1107. 2026-04-13 25/1250 2026-04-14 18:48 by 逍遥三郎
[考研] 机械还有还有名额吗?太难了 +8 笑笑袁 2026-04-10 8/400 2026-04-14 08:44 by screening
[考研] 297工科,求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 一志愿0807 数一英一 313 有没有二轮调剂 +12 emokidd 2026-04-08 13/650 2026-04-13 08:32 by lhj2009
[考研] 299求调剂 +8 ZVVZ13 2026-04-08 8/400 2026-04-12 00:40 by 蓝云思雨
[考研] 化工调剂求导师收留!一志愿失利,踏实肯干,有植物提取科研经历 +20 yzyzx 2026-04-09 21/1050 2026-04-12 00:12 by 小小小小啦啦啦
[考研] 药学专硕调剂 +8 ? 一路生?花? 2026-04-10 10/500 2026-04-11 21:21 by zhouxiaoyu
[考研] 303求调剂 +14 SereinQ 2026-04-10 15/750 2026-04-11 20:43 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂 +6 电气300求调剂不 2026-04-08 6/300 2026-04-11 20:14 by 逆水乘风
[考研] 0854调剂 +5 音像店听花鼓戏 2026-04-10 5/250 2026-04-11 10:49 by qingpingzhu
[考研] 中药学调剂 初试324 +4 洋甘菊、 2026-04-10 6/300 2026-04-11 09:41 by gong120082
[考研] 化学工程与技术324调剂 +23 孙常华 2026-04-09 25/1250 2026-04-11 00:07 by 骑牛渡寒江
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +6 白云123456789 2026-04-09 8/400 2026-04-10 21:13 by zhouxiaoyu
[考研] 22408 366分,本科211,一志愿西工大 +4 Rubt 2026-04-09 4/200 2026-04-10 19:51 by chemisry
[考研] 一志愿矿大,材料工程专硕314分,0856可调都可以 +15 无懈可击的巨人 2026-04-09 15/750 2026-04-10 18:10 by hmn_wj
[考研] 求调剂 +11 翩翩一书生 2026-04-09 13/650 2026-04-10 10:27 by liuhuiying09
[考研] 本科211 工科085400 280分求调剂 可跨专业 +3 LZH(等待调剂中 2026-04-09 3/150 2026-04-09 21:29 by wutongshun
[考研] 求调剂材料科学与工程一志愿985初试365分 +5 材化李可 2026-04-08 5/250 2026-04-09 17:00 by Lilly_Li
[考研] 286求调剂 +19 Faune 2026-04-08 20/1000 2026-04-09 08:36 by 哦哦123
信息提示
请填处理意见