| 查看: 8521 | 回复: 40 | |||||||||||||||
一声叹息010木虫 (小有名气)
|
[交流]
搭建正二十面体金属团簇 已有28人参与
|
||||||||||||||
由于某些原因， 我想搭建一些金属团簇，过程真的有些曲折，我都准备写个小脚本计算空间坐标了 。幸好发现了剑桥大学团簇库，可以直接获得团簇的原子坐标。 http://www-wales.ch.cam.ac.uk/CCD.html 比如，我想得到包含147个Au原子的正二十面体。      复制所有坐标，新建一个Excel表格， 将坐标粘贴到B3单元格：点右键-->选择性粘贴-->无格式文本。然后在A1单元格输入原子数，如此例中的147；在A3单元格输入元素符号，如此例中的Au，通过向下拖动A3单元格快速复制Au；在A2单元格随便写点东西方便回顾，可以不写；  文件-->另存为，另存为.txt格式的文本文件   大部分计算软件都可以读取.xyz格式的文件，比如Materials Studio  点击右键，改变一下显示方式   居然没有金属键，Build一下的默认值就有了：Build-->Bonds  如果出现跨原子的长程键，显然就不合适了，就稍微调调两个滑块 最后，点击clean按钮，使结构合理一些（因为我们之前是套用的Al原子坐标）  [ Last edited by 一声叹息010 on 2013-1-19 at 20:44 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Material Studio | 科研技巧 | 物理前沿 | 催化 |
| 科研工具使用资料 | initio | 第一性原理计算 | science |
| 第一性原理储备知识 | 有机 | 淘淘 | 晶体结构建模经验 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
leilei024542» 猜你喜欢
085701环境工程，267求调剂
已经有12人回复
-
320分，材料与化工专业，求调剂
已经有7人回复
-
085701环境工程求调剂
已经有8人回复
-
295材料工程专硕求调剂
已经有5人回复
-
265求调剂
已经有8人回复
-
322求调剂
已经有4人回复
-
085602 307分 求调剂
已经有6人回复
-
0856，材料与化工321分求调剂
已经有7人回复
-
0703化学求调剂，各位老师看看我！！！
已经有5人回复
-
266分，求材料冶金能源化工等调剂
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 遗传算法搭建团簇稳定构型
已经有8人回复
- 准晶：开除、胡说与擦肩而过
已经有18人回复
杨寻
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 7081.1
- 散金: 29
- 红花: 4
- 帖子: 1146
- 在线: 367小时
- 虫号: 952321
- 注册: 2010-02-04
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
3楼2013-01-19 21:29:21
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
icosahedron ??????????Y?? ????о????? ????????Щ?????????? ?????M??????? ??????ú???ε?????a?? ???Юa??????????????????}?????????? ????????f???? ??a???????С?? icosahedraon (?o????????????) ??????????С?? 12 symmetry ???O???????????? 2 ?? icosahedron ?? 12 ?? symmetry points ????? (+/- Sm, +/- Sp, 0 ) ( 0 , +/- Sm, +/- Sp) (+/- Sp, 0 , +/- Sm) ???? Sm=dsqrt(2-s), Sp=dsqrt(2+s) ?????????Y?? ????? "Clusters and Small Particles: In Gases and Plasmas" ?@???? (????Boris M. Smirnov) ?? 124 ???? icosahedron ?????С?????????? ??????????κ?????? icosaheron ?? |
29楼2015-02-09 05:36:40
杨寻
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 7081.1
- 散金: 29
- 红花: 4
- 帖子: 1146
- 在线: 367小时
- 虫号: 952321
- 注册: 2010-02-04
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2013-01-19 21:26:38
4楼2013-01-19 22:24:02
Lzp425496024
银虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 586.9
- 散金: 236
- 红花: 3
- 帖子: 95
- 在线: 152.7小时
- 虫号: 1851856
- 注册: 2012-06-08
- 性别: GG
- 专业: 金属结构材料
5楼2013-01-19 23:10:18
aaq2800
铁杆木虫 (知名作家)
- 应助: 51 (初中生)
- 金币: 27917.5
- 散金: 1522
- 红花: 29
- 沙发: 1
- 帖子: 9464
- 在线: 2189.1小时
- 虫号: 598401
- 注册: 2008-09-10
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
6楼2013-01-20 09:18:40
7楼2013-01-20 09:52:15
8楼2013-01-20 17:23:40
9楼2013-01-20 20:47:02
一声叹息010
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1552.1
- 红花: 7
- 帖子: 91
- 在线: 110.8小时
- 虫号: 1502781
- 注册: 2011-11-21
- 专业: 理论和计算化学
10楼2013-01-20 21:36:49
6