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ilxmc

新虫 (小有名气)

[交流] gromacs自己添加residue遇到的问题已有3人参与

大家好,最近一直在研究gromacs的residue这块,我根据prodrg给出的top file自己在.rtp中添加了新的residue,具体步骤如下,在选择的force field文件夹中的.rtp中添加residue,在ffbonded.itp里增加新的键的类型,最后更新residuetypes.dat,我认为添加的内容都挺对的,但用pdb2gmx生成top文件时出现这样的错误,我想请问我少了那步呢,不知道还要在什么地方添加东西呢?

Fatal error:
atom N not found in buiding block 2MOL while combining tdb and rtp
For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS
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youngfi

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个帖子不错,感谢jiaoyixiong的指点。在此受教了!
事情没有你想得那么简单但也没有你想得那么复杂。
6楼2013-06-19 22:55:41
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