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真菌转化子PCR验证问题
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碧海行帆
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真菌转化子PCR验证问题
跟大家探讨一个问题,我做真菌的基因敲除,目前得到了24个转化子,进行PCR验证的时候,抗性基因也就是阳性对照成功扩出,要敲除的目的基因都没有扩出,按理说应该是都敲除了,但转化率达到了100%,大家说有这种可能吗???
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1楼
2013-01-05 17:35:48
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cicelyzh
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【答案】应助回帖
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13楼
:
Originally posted by
碧海行帆
at 2013-01-07 09:05:44
12.11.26(zhuanhuazi xiayou yanzheng-2).jpg(14.74KB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4Dfbg2B3qUAQA2e6?p=130497
第一道为mark 第2道到第6道为5个转化子做下游验证,最亮的和我要的目的带大小类似,但杂带很多, ...
没有野生对照吗?这些杂带包括野生的带么?还有我怀疑你PCR时候的模板量太大,所以特异性不行。你用了多少DNA模板?
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14楼
2013-01-07 11:22:56
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zhaodahe
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碧海行帆: 金币+1
2013-01-07 10:45:31
你用抗性做筛选标记,假的都死了,出来假的才不对吧。
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼
2013-01-05 20:36:31
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cicelyzh
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碧海行帆: 金币+4
2013-01-07 10:46:10
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助
2013-01-07 16:51:20
如果有抗性基因而要敲除的基因还在的话才有问题,那说明不能用抗性基因来筛选目的基因了。此外,我觉得你最好不要用PCR负结果来证明敲除基因不在了,应该用敲除基因序列两端的DNA序列做PCR,确定突变株的带(含抗性基因)位置和野生型不同,并且不含野生型的带。
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3楼
2013-01-06 02:27:42
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碧海行帆
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2楼
:
Originally posted by
zhaodahe
at 2013-01-05 20:36:31
你用抗性做筛选标记,假的都死了,出来假的才不对吧。
嗯,但也有抗性基因转进去了,目的基因没转进去的情况啊
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硕士毕业去找工作
4楼
2013-01-06 11:43:47
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