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wofjg2008

新虫 (正式写手)

[求助] 构型优化和文献不一致怎么办?

我现在用高斯09重复一篇文献,构型优化好几次,所用的计算方法、基组、函数都和文献的一致,但是最后的构型总是和文献的构型对不上,几个原子之间的键长总要差上0.05-0.1埃,都优化了好多次了,还是不行,求高手指点!
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yongma2008

木虫 (著名写手)

论文?苦!主。

0.05-0.1埃可以忽略吧,你在同一个机器上算同一个任务,多算几次都有可能不完全一样呢

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-12-11 10:35:47
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wofjg2008

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yongma2008 at 2012-12-11 10:35:47
0.05-0.1埃可以忽略吧,你在同一个机器上算同一个任务,多算几次都有可能不完全一样呢

关键是老师说最好完全对上,还有算的能量也对不上,感觉总是找不到文献说的构型。
3楼2012-12-11 11:11:02
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wofjg2008

新虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by yongma2008 at 2012-12-11 10:35:47
0.05-0.1埃可以忽略吧,你在同一个机器上算同一个任务,多算几次都有可能不完全一样呢

还有个问题想请教一下,就是我在计算的时候需要做一个BSSE校正,不知道做BSSE校正时对构型是否有影响?
4楼2012-12-11 11:12:46
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huilaoshu999

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cenwanglai: 金币+2, 谢谢回复~ 2012-12-11 14:20:53
初始结构不同,优化出的结构可能不同。而且文献上有很多的结构就只有优化,没有频率计算,是否是最低能量构象还不一定呢
5楼2012-12-11 13:04:47
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南飞探

禁虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

6楼2012-12-12 13:48:34
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wofjg2008

新虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 南飞探 at 2012-12-12 13:48:34
高斯的版本不同,算出的结果也会有细微不同哦!

都是用G09。差距应该不会太大吧。
7楼2012-12-12 14:42:43
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ZJboy

木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wofjg2008 at 2012-12-12 14:42:43
都是用G09。差距应该不会太大吧。...

G09也有几个版本
8楼2012-12-12 23:40:08
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
stable=opt 做了么...
9楼2012-12-13 16:27:22
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