24小时热门版块排行榜    

查看: 1333  |  回复: 8

wofjg2008

新虫 (正式写手)

[求助] 构型优化和文献不一致怎么办?

我现在用高斯09重复一篇文献,构型优化好几次,所用的计算方法、基组、函数都和文献的一致,但是最后的构型总是和文献的构型对不上,几个原子之间的键长总要差上0.05-0.1埃,都优化了好多次了,还是不行,求高手指点!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongma2008

木虫 (著名写手)

论文?苦!主。

0.05-0.1埃可以忽略吧,你在同一个机器上算同一个任务,多算几次都有可能不完全一样呢

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-12-11 10:35:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wofjg2008

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yongma2008 at 2012-12-11 10:35:47
0.05-0.1埃可以忽略吧,你在同一个机器上算同一个任务,多算几次都有可能不完全一样呢

关键是老师说最好完全对上,还有算的能量也对不上,感觉总是找不到文献说的构型。
3楼2012-12-11 11:11:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wofjg2008

新虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by yongma2008 at 2012-12-11 10:35:47
0.05-0.1埃可以忽略吧,你在同一个机器上算同一个任务,多算几次都有可能不完全一样呢

还有个问题想请教一下,就是我在计算的时候需要做一个BSSE校正,不知道做BSSE校正时对构型是否有影响?
4楼2012-12-11 11:12:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huilaoshu999

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cenwanglai: 金币+2, 谢谢回复~ 2012-12-11 14:20:53
初始结构不同,优化出的结构可能不同。而且文献上有很多的结构就只有优化,没有频率计算,是否是最低能量构象还不一定呢
5楼2012-12-11 13:04:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南飞探

禁虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

6楼2012-12-12 13:48:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wofjg2008

新虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 南飞探 at 2012-12-12 13:48:34
高斯的版本不同,算出的结果也会有细微不同哦!

都是用G09。差距应该不会太大吧。
7楼2012-12-12 14:42:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wofjg2008 at 2012-12-12 14:42:43
都是用G09。差距应该不会太大吧。...

G09也有几个版本
8楼2012-12-12 23:40:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
stable=opt 做了么...
9楼2012-12-13 16:27:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wofjg2008 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 7/350 2026-08-21 11:45 by 6543yes
[基金申请] 科研孤儿太难了 +15 我4大白菜 2026-08-20 16/800 2026-08-21 11:07 by yming1319
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 让我中一个面上吧! +10 大萍1987 2026-08-20 12/600 2026-08-21 09:31 by 020100099
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +4 archvillain 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:10 by gatelove
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +22 yaoyewhu2008 2026-08-20 24/1200 2026-08-21 07:44 by DanielDDDD
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:05 by spzhao
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见