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lmyiop

金虫 (小有名气)

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专业: 药物设计与药物信息

[求助] 极化作用研究问题

我现在想用QM/MM的方法，研究小分子的某个基团在蛋白环境下被极化时，基团极化方向。请问大家，我应该如何下手？还有一个问题，就是现在有没有什么方法能计算出小分子上某个基团的极化率，而不是计算整个小分子的极化率。

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1楼 2012-11-30 21:49:16

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lmyiop

金虫 (小有名气)

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专业: 药物设计与药物信息

只把取代基拿出来。如何才能计算？这样是不是就少原子了？

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3楼2012-12-01 15:01:49

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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

应助: 214 (大学生)
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专业: 理论和计算化学

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lmyiop: 金币+2, ★有帮助, 说得不很具体 2012-12-02 10:09:15

首先在环境下优化得到小分子构象，然后把取代基部分取出，计算一下试一下吧

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2楼2012-12-01 09:09:46

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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921

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帖子: 6402
在线: 750.9小时
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专业: 理论和计算化学

有这么做的吗？我没有看到过，尤其是计算极化率，你有相关的文献吗？可否发我。谢谢。youzicxb@126.com

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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能

4楼2012-12-03 18:39:08

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