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银虫 (小有名气)

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[交流] 大家用gromacs做膜蛋白有直接从网上下的没？做什么处理了吗？

http://moose.bio.ucalgary.ca/ind ... ures_and_Topologies
大家有用这里面的膜做膜动力学吗？我有一些问题想请教一下：不知道从这里面下载的膜还要做什么处理吗？还是直接用，跑nvt,npt或md没？

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1楼 2012-11-30 16:11:51

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银虫 (小有名气)

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引用回帖:

12楼: Originally posted by superdirac at 2012-12-04 17:08:31
推荐这个网站。
http://www.charmm-gui.org/
极其的强大。

这个网站是由编写charmm的课题组所维护。
在上面，可以生成你想要的所有种类的膜。
并且，这个网站还提供“把蛋白嵌入生物膜” 的功能。
十分 ...

谢谢啦