24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1152  |  回复: 11
本帖产生 1 个 QC强帖 ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

renren123123

金虫 (正式写手)

[求助] 分子优化求助

# opt freq b3lyp/6-31++g(2d,2p) nosymm geom=connectivity

A3

1 1
C                 -0.97218474   -0.04841131    0.00000164
C                  0.74654581    0.02078778    0.00004819
N                  0.00908182    1.08732390    0.00003223
N                 -0.08521263   -1.08127384   -0.00003048
N                 -2.25808564    0.02767855   -0.00010128
H                 -2.82238882   -0.81322348    0.00033844
H                 -2.71249356    0.93088470   -0.00019287

1 3 2.0 4 1.0 5 1.0
2 3 1.0 4 2.0
3
4
5 6 1.0 7 1.0
6
7

这样优化始终优化不出我想要的如opt-model.jpg图结构,不自恰,麻烦哪位高手用高斯03或09帮我找到正确优化的原因,如果有时间,还请优化出来贴上结果,谢谢!

opt-model.JPG
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gauss98

禁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
renren123123: 回帖置顶 2012-11-27 23:12:43
cenwanglai: 金币+5, QC强帖+1, 感谢热心回帖~ 2012-11-28 10:21:31
你原来的结构两个碳原子离得太近了。拉远一点形成一个接近正方形就可以了

我给你调整的初始坐标输入文件:
% nproc=8
# opt freq b3lyp/6-31++g(2d,2p) nosymm geom=connectivity

A3

1 1
C                 -1.13450913   -0.01127887   -0.00000220
C                  0.95631432    0.02923363    0.00005361
N                 -0.03836219    1.04174624    0.00003058
N                 -0.08521300   -1.08127400   -0.00003000
N                 -2.42041013    0.06481113   -0.00010520
H                 -2.98471313   -0.77609087    0.00033380
H                 -2.87481813    0.96801713   -0.00019720

1 3 1.0 4 1.5 5 2.0
2 3 2.0 4 1.5
3
4
5 6 1.0 7 1.0
6
7



优化结束后的结果算频率的坐标:
C,0,-1.0994478143,0.0776653719,-0.1739757193
C,0,0.7433080732,-0.0902050705,0.5030218806
N,0,-0.0435391597,0.9003683894,-0.3201383759
N,0,-0.0614862126,-0.8627745918,-0.2995524251
N,0,-2.3634015779,0.0714470718,0.0499234862
H,0,-2.8801374252,-0.8041990431,0.0808993623
H,0,-2.8770072735,0.9428622623,0.1599051813


注意结果是个局部能量极小点,能量很高,比线性构型能量高很多!

help1.JPG

3楼2012-11-27 11:02:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

lxhlxh052c

木虫 (著名写手)

小木虫之无虫

楼主,我觉得你想要的优化结果像比目鱼啊~
很有艺术细菌啊
这就是我想要的
2楼2012-11-27 10:47:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

renren123123

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gauss98 at 2012-11-27 11:02:53
你原来的结构两个碳原子离得太近了。拉远一点形成一个接近正方形就可以了

我给你调整的初始坐标输入文件:
% nproc=8
# opt freq b3lyp/6-31++g(2d,2p) nosymm geom=connectivity

A3

1 1
C            ...

谢谢楼上gauss98,我按你提供的初始结构优化,还是找不到最终稳定的构型,而且该离子结构完全不在一个平面内,完全变形了,就跟我之前用DFT计算的那样,按照有机化学相关知识,起码这个四元环由于有两个双键应该是在同一平面内的,但末优化(但末收敛)的结构不在同一平面内!麻烦您提供指导!谢谢!感激不尽~
4楼2012-11-27 23:10:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

renren123123

金虫 (正式写手)

谢谢楼上!只是我按你上说的方法做,还是一样很难最终收敛,且四元环完全不在同一平面内,且变形严重!为什么会这样?
5楼2012-11-27 23:11:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿食品科学与工程083200求调剂 +4 XQTJZ 2026-03-30 4/200 2026-03-31 04:10 by fmesaito
[考研] 求调剂,一志愿 南京航空航天大学 ,080500材料科学与工程学硕,总分289分 +9 @taotao 2026-03-29 9/450 2026-03-30 22:29 by 我是小康
[考研] 085600 材料与化工 329分求调剂 +18 Mr. Z 2026-03-25 19/950 2026-03-30 19:01 by Wang200018
[考研] 一志愿厦门大学材料工程专硕354找调剂!!! +5 贝呗钡钡 2026-03-30 5/250 2026-03-30 18:16 by 无际的草原
[考研] 317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求调剂 +12 芋泥小铃铛 2026-03-28 12/600 2026-03-30 17:06 by wangjy2002
[考研] 生物技术与工程 +7 1294608413 2026-03-25 8/400 2026-03-30 11:36 by 唐沐儿
[考研] 0856求调剂 +8 楒桉 2026-03-28 8/400 2026-03-30 10:00 by wzy-lxz
[考研] 2026年华南师范大学欢迎化学,化工,生物,生医工等专业优秀学子加入! +3 llss0711 2026-03-28 6/300 2026-03-29 10:26 by llss0711
[考研] 298求调剂 +4 种圣赐 2026-03-28 4/200 2026-03-29 08:42 by q1092522407
[考研] 343求调剂 +5 爱羁绊 2026-03-28 5/250 2026-03-28 20:53 by 唐沐儿
[考研] 320分,材料与化工专业,求调剂 +9 一定上岸aaa 2026-03-27 13/650 2026-03-28 15:00 by 神马都不懂
[考研] 调剂 +3 好好读书。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 12:04 by 王保杰33
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-27 7/350 2026-03-28 07:43 by 热情沙漠
[考研] 总分322求生物学/生化与分子/生物信息学相关调剂 +5 星沉uu 2026-03-26 6/300 2026-03-26 19:02 by macy2011
[考研] 085602 289分求调剂 +8 WWW西西弗斯 2026-03-24 8/400 2026-03-26 16:33 by 不吃魚的貓
[考研] 化学调剂一志愿上海交通大学336分-本科上海211 +4 小鱼爱有机 2026-03-25 4/200 2026-03-26 10:19 by aa331100
[考研] 各位老师您好:本人初试372分 +5 jj涌77 2026-03-25 6/300 2026-03-25 14:15 by mapenggao
[考研] 求调剂 +3 李李不服输 2026-03-25 3/150 2026-03-25 13:03 by cmz0325
[考研] 293求调剂 +7 加一一九 2026-03-24 7/350 2026-03-25 12:02 by userper
[考研] 086003食品工程求调剂 +6 淼淼111 2026-03-24 6/300 2026-03-25 10:29 by 3Strings
信息提示
请填处理意见