应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请教杂交探针的选择问题
61/1返回列表
查看: 1237  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wpcall

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教杂交探针的选择问题

请教各位，现在有个转基因植物材料，用所转外源目的基因片段做探针的话因转化植物有目的基因的同源基因，二者同源性在65%左右，可以用这个目的基因片段做探针么？是否会把所转植物材料本身基因给杂出来了？
而用KAN抗性基因做探针的话探针GC含量将近60%。
请问选择哪个片段做探针好？用地高辛法进行该实验。
谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-11-22 11:22:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
KAN抗性基因做探针比较好，我们之前也一直选用的抗性标记做探针的，GC含量高的话，杂交TM值可做预实验摸索下
赞一下 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2012-11-22 12:37:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

song1205

金虫 (正式写手)
不是很清楚，只有懂的人来回答这个问题了！
赞一下 回复此楼
我来了！你在哪儿！
3楼2012-11-22 12:37:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seanzhu1996

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
建议用KAN探针，同源达到65%的话使用外源基因作为探针会产生噪音，不利于后继的分析，很可能会拿到很多奇怪的结果。虽然KAN的GC含量高，摸索一下条件应该还是能搞定的。
赞一下 回复此楼
享受每天的生活
4楼2012-11-22 13:28:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wpcall

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by seanzhu1996 at 2012-11-22 13:28:47
建议用KAN探针，同源达到65%的话使用外源基因作为探针会产生噪音，不利于后继的分析，很可能会拿到很多奇怪的结果。虽然KAN的GC含量高，摸索一下条件应该还是能搞定的。

谢谢seanzhu1996，我的目的基因设计时是跨内含子区域的，这样转基因的植物材料中即使有同源基因也会包含很大一个内含子区域，而探针中是没有的，这样是否可以一定程度上避免噪音的产生呢？
赞一下 回复此楼
5楼2012-11-22 15:41:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seanzhu1996

木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wpcall at 2012-11-22 15:41:50
谢谢seanzhu1996，我的目的基因设计时是跨内含子区域的，这样转基因的植物材料中即使有同源基因也会包含很大一个内含子区域，而探针中是没有的，这样是否可以一定程度上避免噪音的产生呢？...

关键是要看你的探针的大小，以及选择的区域，
赞一下 回复此楼
享受每天的生活
6楼2012-11-22 19:34:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wpcall 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-02 06:39 by xzcv0Tehd8lQ
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-02 06:39 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 5/250 2026-11-02 06:07 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 11/550 2026-11-02 06:00 by xzcv0Tehd8lQ
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 9/450 2026-11-02 05:54 by xzcv0Tehd8lQ
[基金申请] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 17/850 2026-11-02 05:50 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 16/800 2026-11-02 05:47 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 14/700 2026-11-02 05:41 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 17/850 2026-11-02 05:34 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 27/1350 2026-11-02 05:28 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 9/450 2026-11-02 03:26 by xzcv0Tehd8lQ
[找工作] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 9/450 2026-11-02 03:05 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +6 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 9/450 2026-11-02 03:00 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 16/800 2026-11-02 02:34 by xzcv0Tehd8lQ
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 22:24 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 22:11 by xzcv0Tehd8lQ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 11/550 2026-11-01 21:35 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 22/1100 2026-11-01 16:35 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 12:40 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 申博自荐 2篇一区TOP+1篇EI+2公开发明专利 2027博士申请 +3 小小阿光 2026-10-27 3/150 2026-10-29 23:56 by 起风了的快乐
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭