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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 怎么输出 原子中核心电子的空间分布文件？
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nodding

木虫 (小有名气)

[求助] 怎么输出 原子中核心电子的空间分布文件？

诚挚请教各位：

怎么输出 原子中核心电子的空间分布文件？
我想利用 cube=（orbitals, Cards）orbitals 中 all - valence 来处理， 但遇到以下几个问题：
1、 all  所有分子轨道，包括占据轨道和空轨道吧。valence 是指所有占据的非核分子轨道， all-valence 是核心原子的轨道吗？
2、由于 all 所有分子轨道 和 valence 分子轨道，文件大小不一，没法用cubman 相减，又该如何处理？
3、能否用 cube=（density, Cards）来得到 核心电子空间分布文件。

真诚向各位请教。谢谢。
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1楼 2012-11-20 11:42:09
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nodding

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2012-11-20 14:30:36
用Multiwfn可以很容易地实现此目的，过程清晰得多。

比如对于B3LYP/6-31G**下的乙酸，共80个轨道，由于有四个第二周期的原子，所以前4个是内核轨道。启动Multiwfn，依次输入
aceticacid.fch  //相应的fch文件
...

多谢。

我先看看，不懂之处再向您请教，希望不吝赐教。
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3楼2012-11-20 14:41:22
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
nodding: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-11-20 14:42:44
cenwanglai: 金币+3, 谢谢回复~ 2012-11-20 19:05:35
用Multiwfn可以很容易地实现此目的，过程清晰得多。

比如对于B3LYP/6-31G**下的乙酸，共80个轨道，由于有四个第二周期的原子，所以前4个是内核轨道。启动Multiwfn，依次输入
aceticacid.fch  //相应的fch文件
6  //修改波函数
26  //设置占据数
5-80  //选择5到第80号轨道，即所有非内核轨道
0  //设占据数为0。现在只剩内核电子了
q
-1  //退回到主菜单
5  //计算格点数据
1  //电子密度
2  //中等质量格点。也可以用其它的设定
2  //输出cube文件到当前目录下density.cub。此即乙酸的内核电子的密度。

Multiwfn也可以直接读取cube文件，然后在主功能13里通过选项11来使之与其它的cube文件相互运算。cubman的功能是Multiwfn主功能13的选项11的功能的子集。
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2楼2012-11-20 14:30:36
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nodding

木虫 (小有名气)
找到一种更简单的方法。

用cubegen 工具，用 FDensity , Density 参数相减即可。
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4楼2012-11-21 11:28:27
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