24小时热门版块排行榜    

查看: 452  |  回复: 3

nodding

木虫 (小有名气)

[求助] 怎么输出 原子中核心电子的空间分布文件?

诚挚请教各位:

怎么输出 原子中核心电子的空间分布文件?
我想利用 cube=(orbitals, Cards)orbitals 中 all - valence 来处理, 但遇到以下几个问题:
1、 all  所有分子轨道,包括占据轨道和空轨道吧。valence 是指所有占据的非核分子轨道, all-valence 是核心原子的轨道吗?
2、由于 all 所有分子轨道 和 valence 分子轨道,文件大小不一,没法用cubman 相减,又该如何处理?
3、能否用 cube=(density, Cards)来得到 核心电子空间分布文件。

真诚向各位请教。谢谢。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
nodding: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-11-20 14:42:44
cenwanglai: 金币+3, 谢谢回复~ 2012-11-20 19:05:35
用Multiwfn可以很容易地实现此目的,过程清晰得多。

比如对于B3LYP/6-31G**下的乙酸,共80个轨道,由于有四个第二周期的原子,所以前4个是内核轨道。启动Multiwfn,依次输入
aceticacid.fch  //相应的fch文件
6  //修改波函数
26  //设置占据数
5-80  //选择5到第80号轨道,即所有非内核轨道
0  //设占据数为0。现在只剩内核电子了
q
-1  //退回到主菜单
5  //计算格点数据
1  //电子密度
2  //中等质量格点。也可以用其它的设定
2  //输出cube文件到当前目录下density.cub。此即乙酸的内核电子的密度。

Multiwfn也可以直接读取cube文件,然后在主功能13里通过选项11来使之与其它的cube文件相互运算。cubman的功能是Multiwfn主功能13的选项11的功能的子集。
2楼2012-11-20 14:30:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nodding

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2012-11-20 14:30:36
用Multiwfn可以很容易地实现此目的,过程清晰得多。

比如对于B3LYP/6-31G**下的乙酸,共80个轨道,由于有四个第二周期的原子,所以前4个是内核轨道。启动Multiwfn,依次输入
aceticacid.fch  //相应的fch文件
...

多谢。

我先看看,不懂之处再向您请教,希望不吝赐教。
3楼2012-11-20 14:41:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nodding

木虫 (小有名气)

找到一种更简单的方法。

用cubegen 工具,用 FDensity , Density 参数相减即可。
4楼2012-11-21 11:28:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 nodding 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化工专硕348,一志愿985求调剂 +4 弗格个 2026-02-28 6/300 2026-02-28 22:00 by wang_dand
[考研] 292求调剂 +3 yhk_819 2026-02-28 3/150 2026-02-28 21:57 by gaoxiaoniuma
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +3 Soliloquy_Q 2026-02-28 3/150 2026-02-28 21:43 by xyx2012xyx
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 4/200 2026-02-28 21:41 by gaoxiaoniuma
[考研] 295求调剂 +5 19171856320 2026-02-28 5/250 2026-02-28 21:39 by gaoxiaoniuma
[考博] 26申博 +4 想申博! 2026-02-26 4/200 2026-02-28 21:37 by limorning
[考研] 材料类求调剂 +6 wana_kiko 2026-02-28 6/300 2026-02-28 21:20 by gaoxiaoniuma
[考研] 求调剂 +4 repeatt?t 2026-02-28 4/200 2026-02-28 21:16 by gaoxiaoniuma
[考研] 284求调剂 +4 天下熯 2026-02-28 4/200 2026-02-28 21:13 by gaoxiaoniuma
[考博] 博士推荐 +5 花儿笑? 2026-02-21 6/300 2026-02-28 18:53 by nxgogo
[考研] 0856材料求调剂 +10 hyf hyf hyf 2026-02-28 11/550 2026-02-28 18:50 by 无际的草原
[考研] 材料调剂 +3 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:06 by houyaoxu
[考博] 博士自荐 +3 kkluvs 2026-02-28 3/150 2026-02-28 16:59 by StarAura
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
[考研] 0856调剂 +3 刘梦微 2026-02-28 3/150 2026-02-28 13:22 by houyaoxu
[考研] 304求调剂 +5 曼殊2266 2026-02-28 6/300 2026-02-28 12:44 by 迷糊CCPs
[硕博家园] 博士自荐 +6 科研狗111 2026-02-26 9/450 2026-02-28 12:32 by seaskyy
[考研] 298求调剂 +4 axyz3 2026-02-28 4/200 2026-02-28 11:21 by wang_dand
[基金申请] 面上可以超过30页吧? +12 阿拉贡aragon 2026-02-22 13/650 2026-02-26 22:09 by Hahaxia
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
请填处理意见