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nodding木虫 (小有名气)
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怎么输出 原子中核心电子的空间分布文件？
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诚挚请教各位： 怎么输出 原子中核心电子的空间分布文件？ 我想利用 cube=（orbitals, Cards）orbitals 中 all - valence 来处理， 但遇到以下几个问题： 1、 all 所有分子轨道，包括占据轨道和空轨道吧。valence 是指所有占据的非核分子轨道， all-valence 是核心原子的轨道吗？ 2、由于 all 所有分子轨道 和 valence 分子轨道，文件大小不一，没法用cubman 相减，又该如何处理？ 3、能否用 cube=（density, Cards）来得到 核心电子空间分布文件。 真诚向各位请教。谢谢。 |
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用Multiwfn可以很容易地实现此目的，过程清晰得多。 比如对于B3LYP/6-31G**下的乙酸，共80个轨道，由于有四个第二周期的原子，所以前4个是内核轨道。启动Multiwfn，依次输入 aceticacid.fch //相应的fch文件 6 //修改波函数 26 //设置占据数 5-80 //选择5到第80号轨道，即所有非内核轨道 0 //设占据数为0。现在只剩内核电子了 q -1 //退回到主菜单 5 //计算格点数据 1 //电子密度 2 //中等质量格点。也可以用其它的设定 2 //输出cube文件到当前目录下density.cub。此即乙酸的内核电子的密度。 Multiwfn也可以直接读取cube文件，然后在主功能13里通过选项11来使之与其它的cube文件相互运算。cubman的功能是Multiwfn主功能13的选项11的功能的子集。 |
2楼2012-11-20 14:30:36
nodding
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