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nodding

木虫 (小有名气)

[求助] 怎么输出 原子中核心电子的空间分布文件?

诚挚请教各位:

怎么输出 原子中核心电子的空间分布文件?
我想利用 cube=(orbitals, Cards)orbitals 中 all - valence 来处理, 但遇到以下几个问题:
1、 all  所有分子轨道,包括占据轨道和空轨道吧。valence 是指所有占据的非核分子轨道, all-valence 是核心原子的轨道吗?
2、由于 all 所有分子轨道 和 valence 分子轨道,文件大小不一,没法用cubman 相减,又该如何处理?
3、能否用 cube=(density, Cards)来得到 核心电子空间分布文件。

真诚向各位请教。谢谢。
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
nodding: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-11-20 14:42:44
cenwanglai: 金币+3, 谢谢回复~ 2012-11-20 19:05:35
用Multiwfn可以很容易地实现此目的,过程清晰得多。

比如对于B3LYP/6-31G**下的乙酸,共80个轨道,由于有四个第二周期的原子,所以前4个是内核轨道。启动Multiwfn,依次输入
aceticacid.fch  //相应的fch文件
6  //修改波函数
26  //设置占据数
5-80  //选择5到第80号轨道,即所有非内核轨道
0  //设占据数为0。现在只剩内核电子了
q
-1  //退回到主菜单
5  //计算格点数据
1  //电子密度
2  //中等质量格点。也可以用其它的设定
2  //输出cube文件到当前目录下density.cub。此即乙酸的内核电子的密度。

Multiwfn也可以直接读取cube文件,然后在主功能13里通过选项11来使之与其它的cube文件相互运算。cubman的功能是Multiwfn主功能13的选项11的功能的子集。
2楼2012-11-20 14:30:36
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nodding

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2012-11-20 14:30:36
用Multiwfn可以很容易地实现此目的,过程清晰得多。

比如对于B3LYP/6-31G**下的乙酸,共80个轨道,由于有四个第二周期的原子,所以前4个是内核轨道。启动Multiwfn,依次输入
aceticacid.fch  //相应的fch文件
...

多谢。

我先看看,不懂之处再向您请教,希望不吝赐教。
3楼2012-11-20 14:41:22
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nodding

木虫 (小有名气)

找到一种更简单的方法。

用cubegen 工具,用 FDensity , Density 参数相减即可。
4楼2012-11-21 11:28:27
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