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木虫 (知名作家)

[交流] 被比对序列的AAAAAAA被自动改成了NNNNNNN是为什么？

KEGG中被比对序列的AAAAAAA被自动改成了NNNNNNN是为什么？在NCBI中即使没被改变6个A也变成了灰色的，这表示序列有疑问吗？

KEGG比对.jpg

NCBI比对.jpg

[ Last edited by 看天 on 2012-11-10 at 00:13 ]

1楼 2012-11-10 00:12:25

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铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
看天(金币+1): 谢谢参与
看天: 金币+4, 谢谢 2012-11-10 11:25:30
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-10 15:39:07

KEGG中A为什么改成N，这个不清楚。但是NCBI中大写的变为灰色小写是因为这段序列是低复杂区，因为在序列比对时，低复杂区的比对结果容易出现比对错误，如连续的同种碱基，或连续规律性碱基组合，所以NCBI就将该区域用灰色小写标出以提示该区比对结果可能有误，对于你的序列不用管这个。

4楼2012-11-10 09:50:43

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