版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (3162)
>虫友互识 (1072)
>休闲灌水 (231)
>导师招生 (165)
>文献求助 (102)
>论文投稿 (69)
>博后之家 (42)
>考博 (41)
>基金申请 (31)
>考研 (31)
>硕博家园 (29)
>招聘信息布告栏 (27)
>找工作 (26)
>教师之家 (21)
>论文道贺祈福 (17)
>公派出国 (17)

返回列表

看天

木虫 (知名作家)

应助: 29 (小学生)
贵宾: 1.415
金币: 401
帖子: 9526
在线: 758.5小时
虫号: 866832

[交流] 被比对序列的AAAAAAA被自动改成了NNNNNNN是为什么？

KEGG中被比对序列的AAAAAAA被自动改成了NNNNNNN是为什么？在NCBI中即使没被改变6个A也变成了灰色的，这表示序列有疑问吗？

KEGG比对.jpg

NCBI比对.jpg

[ Last edited by 看天 on 2012-11-10 at 00:13 ]

回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

NCBI 基因结构

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2012-11-10 00:12:25

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

494750284

木虫 (小有名气)

应助: 15 (小学生)
金币: 3406.1
帖子: 256
在线: 153.6小时
虫号: 1033236

★ ★ ★
看天(金币+1): 谢谢参与
看天: 金币+2, 鼓励一下啊 2012-11-10 13:29:22

我认为N代表A\T\G\C四种碱基。在此处意味着没测到此序列。建议问问测序公司里的人

赞一下

回复此楼

3楼2012-11-10 08:24:25

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

MolEPI: 2
应助: 682 (博士)
金币: 6507
帖子: 1559
在线: 801.6小时
虫号: 1427240

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
看天(金币+1): 谢谢参与
看天: 金币+4, 谢谢 2012-11-10 11:25:30
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-10 15:39:07

KEGG中A为什么改成N，这个不清楚。但是NCBI中大写的变为灰色小写是因为这段序列是低复杂区，因为在序列比对时，低复杂区的比对结果容易出现比对错误，如连续的同种碱基，或连续规律性碱基组合，所以NCBI就将该区域用灰色小写标出以提示该区比对结果可能有误，对于你的序列不用管这个。

赞一下(1人)

回复此楼

4楼2012-11-10 09:50:43

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

看天

木虫 (知名作家)

应助: 29 (小学生)
贵宾: 1.415
金币: 401
帖子: 9526
在线: 758.5小时
虫号: 866832

那应该是序列不够可信吧

赞一下

回复此楼

5楼2012-11-10 13:29:53

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

hongqifei

木虫 (小有名气)

应助: 47 (小学生)
金币: 2412.9
帖子: 261
在线: 134.5小时
虫号: 582655

★
看天(金币+1): 谢谢参与

引用回帖:

4楼: Originally posted by stone2239 at 2012-11-10 09:50:43
KEGG中A为什么改成N，这个不清楚。但是NCBI中大写的变为灰色小写是因为这段序列是低复杂区，因为在序列比对时，低复杂区的比对结果容易出现比对错误，如连续的同种碱基，或连续规律性碱基组合，所以NCBI就将该区域用 ...

学习了。

回复此楼

6楼2012-11-10 13:36:52

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖