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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » Gromacs为什么小体系能跑通，放大体系之后就跑死了？
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yiran870804

新虫 (小有名气)

[交流] Gromacs为什么小体系能跑通，放大体系之后就跑死了？

我的模型很简单。只有非键作用，小体系跑时，可以跑通，放大体系（密度不变），就会跑死，这是什么原因？
       有时候，同样的体系，褪火速率减慢也会跑死，这是为什么？
       麻烦大家帮帮忙，这老死的，真是要崩溃了...
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1楼2012-11-07 17:13:49
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
★ ★ ★
yiran870804(金币+1): 谢谢参与
jiaoyixiong: 回帖置顶 2012-11-08 08:10:50
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-11-08 12:06:51
几点建议：
1、系统变大，大到什么程度？是不是你的计算机内存不够了？
2、是不是你建大体系的时候，模型有问题？下次交流问题的时候，最好把log文件里的错误提示一起贴出来，方便大家帮你找到原因。
3、求助帖子，建议不要设置成回帖就给金币，这样你看看你得到回复的效率并不高，可是设置成手动给与金币。
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yiran870804
30楼2012-11-07 20:27:39
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userhung

禁虫 (文学泰斗)
★
yiran870804(金币+1): 谢谢参与
http://www.doc88.com/p-79959384353.html
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14楼2012-11-07 18:39:08
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乾坤智林5楼
2012-11-07 17:35   回复  
yiran870804(金币+1): 谢谢参与
:-O [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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