24小时热门版块排行榜    

查看: 1490  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xiaoluoj

金虫 (正式写手)

[求助] 菜鸟提问:关于搜索过渡态的问题

在搜索过渡态的问题中,一般是在初始结构(I)与末态结构(F)之间插入一些images,然后再进行搜索过程,得到能量。我的问题是,为什么不直接以这些image作为POSCAR而直接进行自洽计算得到能量,作图,这样应该也能找到势垒啊
  请高手指教。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

X.Wang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
xiaoluoj: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-11-05 13:15:54
这两者是不一样的,只是“直接以这些image作为POSCAR而直接进行自洽计算得到能量”这个计算相当整个体系的能量都是你猜测的,比如说你可以调控扩散的原子按照预计的路径扩散,但是他四周的原子呢,怎么设置,以什么为依据,不会每一个位置上其它原子都是一样的,必然是需要相应变化的,而且你怎么知道你预计的路径就是自小能量路径MEP
而采用NEB或是C-NEB方法正是基于此问题考虑的
所以建议读一些相关文献,或是去官网看看
5楼2012-11-04 20:32:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiaoluoj: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-10-31 09:27:11
直接进行自洽计算得到能垒 明显不对!  线性插入images的时候, 一些列镜像结构并不一定在the minimum energy path上,(通常情况下都不在,如果在的话,就不用算了,直接收敛了)。建议研读一下相关过渡态的文献。
从明天开始坚持吃早饭呀!
2楼2012-10-30 23:52:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoluoj

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wzbhit at 2012-10-30 23:52:02
直接进行自洽计算得到能垒 明显不对!  线性插入images的时候, 一些列镜像结构并不一定在the minimum energy path上,(通常情况下都不在,如果在的话,就不用算了,直接收敛了)。建议研读一下相关过渡态的文献。

能推荐一些相关资料吗? 谢谢
3楼2012-10-31 09:28:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流, 2012-11-05 14:56:17
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoluoj at 2012-10-31 09:28:00
能推荐一些相关资料吗? 谢谢...

你用的是NEB /CI-NEB 来搜索过渡态么?! 如果是的话
那请查看如下文献:
G. Mills, H. Jonsson and G. K. Schenter, Surface Science, 324, 305 (1995).
H. Jonsson, G. Mills and K. W. Jacobsen, `Nudged Elastic Band Method for Finding Minimum Energy Paths of Transitions', in `Classical and Quantum Dynamics in Condensed Phase Simulations', ed. B. J. Berne, G. Ciccotti and D. F. Coker (World Scientific, 1998).
CI-NEB请参考如下链接相关内容及文献:
http://theory.cm.utexas.edu/henkelman/research/saddle/
从明天开始坚持吃早饭呀!
4楼2012-10-31 09:50:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +3 wangyl_123 2026-10-10 6/300 2026-10-11 15:04 by Abin0406
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +3 好运来~9527 2026-10-10 5/250 2026-10-11 09:00 by 好运来~9527
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +5 13108017953 2026-10-08 5/250 2026-10-10 11:15 by wdwd123
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见