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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 菜鸟提问：关于搜索过渡态的问题
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xiaoluoj

金虫 (正式写手)

[求助] 菜鸟提问：关于搜索过渡态的问题

在搜索过渡态的问题中，一般是在初始结构（I）与末态结构(F)之间插入一些images，然后再进行搜索过程，得到能量。我的问题是，为什么不直接以这些image作为POSCAR而直接进行自洽计算得到能量，作图，这样应该也能找到势垒啊
  请高手指教。
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1楼 2012-10-30 19:05:34
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiaoluoj: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-10-31 09:27:11
直接进行自洽计算得到能垒 明显不对！  线性插入images的时候， 一些列镜像结构并不一定在the minimum energy path上，（通常情况下都不在，如果在的话，就不用算了，直接收敛了）。建议研读一下相关过渡态的文献。
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从明天开始坚持吃早饭呀！
2楼2012-10-30 23:52:02
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xiaoluoj

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wzbhit at 2012-10-30 23:52:02
直接进行自洽计算得到能垒 明显不对！  线性插入images的时候， 一些列镜像结构并不一定在the minimum energy path上，（通常情况下都不在，如果在的话，就不用算了，直接收敛了）。建议研读一下相关过渡态的文献。

能推荐一些相关资料吗？ 谢谢
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3楼2012-10-31 09:28:00
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流， 2012-11-05 14:56:17
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoluoj at 2012-10-31 09:28:00
能推荐一些相关资料吗？ 谢谢...

你用的是NEB /CI-NEB 来搜索过渡态么？！ 如果是的话
那请查看如下文献：
G. Mills, H. Jonsson and G. K. Schenter, Surface Science, 324, 305 (1995).
H. Jonsson, G. Mills and K. W. Jacobsen, `Nudged Elastic Band Method for Finding Minimum Energy Paths of Transitions', in `Classical and Quantum Dynamics in Condensed Phase Simulations', ed. B. J. Berne, G. Ciccotti and D. F. Coker (World Scientific, 1998).
CI-NEB请参考如下链接相关内容及文献：
http://theory.cm.utexas.edu/henkelman/research/saddle/
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从明天开始坚持吃早饭呀！
4楼2012-10-31 09:50:49
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X.Wang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
xiaoluoj: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-11-05 13:15:54
这两者是不一样的，只是“直接以这些image作为POSCAR而直接进行自洽计算得到能量”这个计算相当整个体系的能量都是你猜测的，比如说你可以调控扩散的原子按照预计的路径扩散，但是他四周的原子呢，怎么设置，以什么为依据，不会每一个位置上其它原子都是一样的，必然是需要相应变化的，而且你怎么知道你预计的路径就是自小能量路径MEP
而采用NEB或是C-NEB方法正是基于此问题考虑的
所以建议读一些相关文献，或是去官网看看
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5楼2012-11-04 20:32:22
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Lathander

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
xiaoluoj: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-11-05 13:16:03
因为只relax一个image很有可能是那个image relax到local minimum去了,NEB relax的是整个路径，而不是仅仅是几个image
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6楼2012-11-05 11:37:46
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xiaoluoj

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by Lathander at 2012-11-05 11:37:46
因为只relax一个image很有可能是那个image relax到local minimum去了,NEB relax的是整个路径，而不是仅仅是几个image

请问在OUTCAR中如何查看其收敛情况
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7楼2012-11-05 13:17:42
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xiaoluoj

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by X.Wang at 2012-11-04 20:32:22
这两者是不一样的，只是“直接以这些image作为POSCAR而直接进行自洽计算得到能量”这个计算相当整个体系的能量都是你猜测的，比如说你可以调控扩散的原子按照预计的路径扩散，但是他四周的原子呢，怎么设置，以什么 ...

请问在OUTCAR中如何查看其收敛情况
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8楼2012-11-05 13:18:03
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