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小雨莎莎

木虫 (正式写手)

[交流] 请教如何预测一段氨基酸序列的亲水性? 已有1人参与

筛选出一系列的多肽序列,想要预测一下它们的亲水性如何,不知道该怎么计算或者有什么网站可以直接输入序列就能给出结果的?谢谢各位!
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1.使用ProtParam(physico-chemical parameters of a protein sequences,http://web.expasy.org/protparam/)在线软件计算氨基酸理化参数。操作时可直接输入已知蛋白的Swiss-Prot数据库记录号或标识符,或将不包括注释行的未知蛋白质序列输入对应文本框中。点击Compute Parameters获取结果,结果包括蛋白质分子量、理论等电点、氨基酸组成、带电荷氨基酸数目统计、原子组成、消光系数、半衰期、不稳定系数、总平均疏水性等信息。
2.使用ExPASy的ProtScale程序(http://www.expasy.org/cgi-bin/protscale.pl)分析蛋白质的亲疏水性,得到亲疏水性图谱。

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2楼2012-10-16 07:15:25
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小雨莎莎

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2012-10-16 07:15:25
1.使用ProtParam(physico-chemical parameters of a protein sequences,http://web.expasy.org/protparam/)在线软件计算氨基酸理化参数。操作时可直接输入已知蛋白的Swiss-Prot数据库记录号或标识符,或将不包括 ...

谢谢!!
3楼2012-10-16 10:13:31
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