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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 基因芯片试验求助~
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霍烨zz

银虫 (小有名气)

[求助] 基因芯片试验求助~ 已有1人参与

老板安排要我做一个基因芯片试验，由于花费较高，所以不敢轻易开始。有些相关的问题想问问各位虫子~
一个处理组三个重复够了吗？
一个重复一只老鼠可以吗？
为什么有的试验是把一个重复的样混合在一起进行芯片测试的呢？

PS:做基因芯片哪家公司比较好呢？上海伯豪怎么样？
   最后的数据分析是公司做好的吗？

[ Last edited by 霍烨zz on 2012-10-15 at 18:51 ]
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1楼 2012-10-15 18:46:33
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shygza

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
霍烨zz: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-10-16 20:30:19
混合可能为了消除个体差异，我看到有文章说这样pool在一起的话15个样本比较合适，然后再三次重复消除技术误差；
公司一般做到差异基因提取和简单的基因注释及通路注释为止了，再往下做像要用IPA，metacore之类的分析的话一般需要和你交流具体实验设计，研究背景等等，这种芯片公司不会费那么大劲给你做的。
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4楼2012-10-16 11:19:20
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看天

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
霍烨zz: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-10-16 20:29:59
我们正在做 听说除上海伯豪外还有北京一个比较有名
一般来价格一个点要做三个平行重复 三个要是都做的话费用太高 所以可能有人将三个平行样混合后 进行分析 相当于秋平均了  我觉得这样很好
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戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
2楼2012-10-15 23:08:16
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
霍烨zz: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-10-16 20:30:12
三个重复是最低要求，如果数据偏差很大，那还要加数据。
样品混合还有一个可能性就是标记物不同
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3楼2012-10-16 07:07:06
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霍烨zz

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 看天 at 2012-10-15 23:08:16
我们正在做 听说除上海伯豪外还有北京一个比较有名
一般来价格一个点要做三个平行重复 三个要是都做的话费用太高 所以可能有人将三个平行样混合后 进行分析 相当于秋平均了  我觉得这样很好

这样混合做的话只用两张片子就可以了吗？
写文章的时候会不会被质疑呢？
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5楼2012-10-16 20:32:21
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