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霍烨zz

银虫 (小有名气)

[求助] 基因芯片试验求助~ 已有1人参与

老板安排要我做一个基因芯片试验,由于花费较高,所以不敢轻易开始。有些相关的问题想问问各位虫子~
一个处理组三个重复够了吗?
一个重复一只老鼠可以吗?
为什么有的试验是把一个重复的样混合在一起进行芯片测试的呢?

PS:做基因芯片哪家公司比较好呢?上海伯豪怎么样?
   最后的数据分析是公司做好的吗?

[ Last edited by 霍烨zz on 2012-10-15 at 18:51 ]
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看天

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
霍烨zz: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-10-16 20:29:59
我们正在做 听说除上海伯豪外还有北京一个比较有名
一般来价格一个点要做三个平行重复 三个要是都做的话费用太高 所以可能有人将三个平行样混合后 进行分析 相当于秋平均了  我觉得这样很好
戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
2楼2012-10-15 23:08:16
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
霍烨zz: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-10-16 20:30:12
三个重复是最低要求,如果数据偏差很大,那还要加数据。
样品混合还有一个可能性就是标记物不同
3楼2012-10-16 07:07:06
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shygza

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
霍烨zz: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-10-16 20:30:19
混合可能为了消除个体差异,我看到有文章说这样pool在一起的话15个样本比较合适,然后再三次重复消除技术误差;
公司一般做到差异基因提取和简单的基因注释及通路注释为止了,再往下做像要用IPA,metacore之类的分析的话一般需要和你交流具体实验设计,研究背景等等,这种芯片公司不会费那么大劲给你做的。
4楼2012-10-16 11:19:20
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霍烨zz

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 看天 at 2012-10-15 23:08:16
我们正在做 听说除上海伯豪外还有北京一个比较有名
一般来价格一个点要做三个平行重复 三个要是都做的话费用太高 所以可能有人将三个平行样混合后 进行分析 相当于秋平均了  我觉得这样很好

这样混合做的话只用两张片子就可以了吗?
写文章的时候会不会被质疑呢?
5楼2012-10-16 20:32:21
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霍烨zz

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by shygza at 2012-10-16 11:19:20
混合可能为了消除个体差异,我看到有文章说这样pool在一起的话15个样本比较合适,然后再三次重复消除技术误差;
公司一般做到差异基因提取和简单的基因注释及通路注释为止了,再往下做像要用IPA,metacore之类的分 ...

一个重复15个样,感觉太多了,有些费钱啊~
像老鼠这种小动物,一个重复安排一只可以吗?
重复的样本安排多了,采样的时候也不能保证时间一致啊~
6楼2012-10-16 20:37:13
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霍烨zz

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wizardfan at 2012-10-16 07:07:06
三个重复是最低要求,如果数据偏差很大,那还要加数据。
样品混合还有一个可能性就是标记物不同

芯片试验这么贵,再加重复是不可能的了~~
就是想知道怎么样安排才算比较合理,既保证了试验效果,又控制好了试验花费
7楼2012-10-16 20:40:17
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shygza

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 霍烨zz at 2012-10-16 20:37:13
一个重复15个样,感觉太多了,有些费钱啊~
像老鼠这种小动物,一个重复安排一只可以吗?
重复的样本安排多了,采样的时候也不能保证时间一致啊~...

我是指混合15个样做一次实验。。。
8楼2012-10-17 13:32:19
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wangningbo

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

还有博奥生物也就是生物芯片国家工程中心,详细可以交流wangnb123@126.com
9楼2016-09-29 11:42:59
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