24小时热门版块排行榜    

查看: 1448  |  回复: 5

469187892

银虫 (小有名气)

[交流] 大家有做gromacs膜蛋白的交流下啊 已有3人参与

大家有没有用gromacs做膜蛋白动力学的,交流一下,现在自己很迷茫,希望高手指点一下!
回复此楼
加油!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
先说说你哪里迷茫?
2楼2012-10-15 15:55:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

469187892

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-10-15 15:55:32
先说说你哪里迷茫?

我做的体系含有[2FE-2S], [3FE-4S], [4FE-4S]cluster ,参数不知道该怎么设置 ,而且不清楚怎么调整蛋白与磷脂双分子层的位置,如果用pymol调整的话,原子编号就全乱了,与.top文件不一致,求帮助!
加油!
3楼2012-10-16 11:41:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

469187892

银虫 (小有名气)

问题已解决,呵呵
加油!
4楼2012-11-29 08:58:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiameng0010

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你好,我还没入门,我想问你一下,在packmol中建的一个磷脂膜怎样在gromacs中进行分子动力学模拟,我实在不会把那个pdb格式的文件转化成gro格式的.
不论我的对手有多么强大,我都不会轻易说我输了.
5楼2015-07-11 15:38:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

angjzy

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by xiameng0010 at 2015-07-11 15:38:36
你好,我还没入门,我想问你一下,在packmol中建的一个磷脂膜怎样在gromacs中进行分子动力学模拟,我实在不会把那个pdb格式的文件转化成gro格式的.

editconf 可以再pdb和gro间转换
6楼2015-07-21 00:15:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 469187892 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +3 zhaosm1982 2026-08-27 3/150 2026-08-27 10:48 by iwuli
[基金申请] 面上合作单位盖章 +3 ssyjh 2026-08-27 3/150 2026-08-27 09:59 by 阿拉贡aragon
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +4 a089 2026-08-26 5/250 2026-08-27 09:24 by Howard28
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 +7 晴天加油 2026-08-26 8/400 2026-08-27 07:53 by longfie172
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
信息提示
请填处理意见