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yqh1987

银虫 (初入文坛)

[求助] 菌种鉴定序列比对中遇到的问题

想鉴定一株菌,做的16S rDNA部分序列测序,要建系统发育树,去NCBI网站blast比对,在Database选项中要选择others,但是他下面是个下拉框,里面有许多选项,不知道该选哪个啊?是nucleotide collection还是选最后一个的16S ribosomal RNA sequencces??
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yqh1987

银虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by lark001 at 2012-10-12 10:25:36
将你所需要比对的序列输进去后,在Database选项中要选择others,在他下面下拉框选nucleotide collection,点击blast,(其他参数根据需要选择)过一会儿即可出现比对结果。
具体可以看看这可帖子:熟练使用NCBI
h ...

十分感谢!
3楼2012-10-12 10:31:48
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lark001

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yqh1987: 金币+6, ★★★很有帮助 2012-10-12 10:31:59
yqh1987: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-10-12 10:32:13
将你所需要比对的序列输进去后,在Database选项中要选择others,在他下面下拉框选nucleotide collection,点击blast,(其他参数根据需要选择)过一会儿即可出现比对结果。
具体可以看看这可帖子:熟练使用NCBI
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-10-12 10:25:36
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