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yqh1987银虫 (初入文坛)
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菌种鉴定序列比对中遇到的问题
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| 想鉴定一株菌,做的16S rDNA部分序列测序,要建系统发育树,去NCBI网站blast比对,在Database选项中要选择others,但是他下面是个下拉框,里面有许多选项,不知道该选哪个啊?是nucleotide collection还是选最后一个的16S ribosomal RNA sequencces?? |
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lark001
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将你所需要比对的序列输进去后,在Database选项中要选择others,在他下面下拉框选nucleotide collection,点击blast,(其他参数根据需要选择)过一会儿即可出现比对结果。 具体可以看看这可帖子:熟练使用NCBI http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923 |
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yqh1987
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