| 查看: 672 | 回复: 2 | ||
yqh1987银虫 (初入文坛)
|
[求助]
菌种鉴定序列比对中遇到的问题
|
| 想鉴定一株菌,做的16S rDNA部分序列测序,要建系统发育树,去NCBI网站blast比对,在Database选项中要选择others,但是他下面是个下拉框,里面有许多选项,不知道该选哪个啊?是nucleotide collection还是选最后一个的16S ribosomal RNA sequencces?? |
» 猜你喜欢
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有11人回复
表哥与省会女结婚,父母去帮带孩子被省会女气回家生重病了
已经有7人回复
同年申请2项不同项目,第1个项目里不写第2个项目的信息,可以吗
已经有8人回复
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有7人回复
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有10人回复
天津大学招2026.09的博士生,欢迎大家推荐交流(博导是本人)
已经有9人回复
有院领导为了换新车,用横向课题经费买了俩车
已经有10人回复
AI 太可怕了,写基金时,提出想法,直接生成的文字比自己想得深远,还有科学性
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
菌种鉴定的费用悬殊?鉴定内容却…?请教各位前辈啊。
已经有26人回复
菌种鉴定/微生物鉴定/微生物菌种鉴定(细菌、酵母、放线菌、霉菌鉴定)
已经有787人回复
镰刀菌种的鉴定
已经有10人回复
菌种鉴定怎样选取培养基
已经有6人回复
关于菌株16SrDNA序列鉴定的问题
已经有4人回复
根据已知序列,从相同菌种(菌株编号不同)中能PCR出目的基因吗?
已经有6人回复
①Dyella marensis为何菌?②Biolog菌种鉴定问题。
已经有6人回复
【求助/交流】哪里可以做细菌菌种鉴定?
已经有16人回复
【求助/交流】关于16srRNA菌种鉴定问题
已经有14人回复
【求助/交流】关于系统发育树,如何鉴定菌种
已经有12人回复
lark001
新虫 (小有名气)
- 应助: 17 (小学生)
- 金币: 12707.3
- 散金: 50
- 红花: 2
- 帖子: 69
- 在线: 743.6小时
- 虫号: 1842155
- 注册: 2012-05-31
- 专业: 环境地球化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yqh1987: 金币+6, ★★★很有帮助 2012-10-12 10:31:59
yqh1987: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-10-12 10:32:13
感谢参与,应助指数 +1
yqh1987: 金币+6, ★★★很有帮助 2012-10-12 10:31:59
yqh1987: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-10-12 10:32:13
|
将你所需要比对的序列输进去后,在Database选项中要选择others,在他下面下拉框选nucleotide collection,点击blast,(其他参数根据需要选择)过一会儿即可出现比对结果。 具体可以看看这可帖子:熟练使用NCBI http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923 |
» 本帖已获得的红花(最新10朵)
2楼2012-10-12 10:25:36
yqh1987
银虫 (初入文坛)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 352.5
- 散金: 30
- 帖子: 49
- 在线: 80.5小时
- 虫号: 1334090
- 注册: 2011-06-29
- 性别: GG
- 专业: 食品科学基础
3楼2012-10-12 10:31:48













回复此楼
yqh1987