| 查看: 1410 | 回复: 1 | ||
[求助]
只知道目的基因名称，如何比对现有引物好坏
|
|
大背景：现在在做关于一个叫amoA的基因在海洋中分布及含量的课题。主要手法就是用qPCR技术分析海水DNA样本看这种基因数量上的分布。 小背景：现有文献中用于扩增amoA基因的引物有两种，除了用实验来确定哪一种引物能检出更多的copies以外，还想用软件分析一下这两种引物的基本信息（各种参数等），比如有没有发夹结构，二聚体的情况，特异性等等。。 问题：我现在知道这两种引物的序列，也知道目的基因的名称叫amoA，但是，用primer－blast分析的时候貌似需要目的基因序列。。在NCBI上搜索｀amoA｀基因会出现很多结果，但是选择了几个序列试了一下，primer－blast都出不来结果。系统总是显示：Specified left primer cannot be found in template...make sure this primer is on the plus strand of your template. 到底是什么原因呢？是我的目的基因的序列找的不对吗？在只知道基因名称的情况下，如何对比不同引物的各项参数呢？？？ 恳请各位赐教！！拜谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有82人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 想要设计引物 可是NCBI中blast后只有蛋白序列 如何得到基因序列 谢谢啊
已经有15人回复
- 要P一段基因全长，已知CDS，怎么设计引物啊？
已经有10人回复
- 已经带his标签目的蛋白基因如何设计引物啊（目的基因已经接在pET-22b的载体上了）
已经有8人回复
- 如何设计引物，扩增目的基因的ORF？
已经有6人回复
- 【求助/交流】怎样设计目的基因的引物
已经有8人回复
- 【求助/交流】（引物设计）怎么防止pET28a中Nco1的ATG影响目的基因的表达？
已经有9人回复
- 【求助】求教基因克隆中的引物设计问题【有效期至2010年11月18日】
已经有6人回复
2楼2015-03-22 09:37:53
